ViewVC Help
View File | Revision Log | Show Annotations | View Changeset | Root Listing
root/group/trunk/OOPSE/libmdtools/mpiSimulation.cpp
(Generate patch)

Comparing trunk/OOPSE/libmdtools/mpiSimulation.cpp (file contents):
Revision 416 by gezelter, Wed Mar 26 23:14:02 2003 UTC vs.
Revision 422 by mmeineke, Thu Mar 27 19:21:42 2003 UTC

# Line 25 | Line 25 | mpiSimulation::mpiSimulation(SimInfo* the_entryPlug)
25  
26    MolToProcMap = new int[entryPlug->n_mol];
27    MolComponentType = new int[entryPlug->n_mol];
28 –
28    AtomToProcMap = new int[entryPlug->n_atoms];
29  
30    mpiSim = this;
# Line 35 | Line 34 | mpiSimulation::~mpiSimulation(){
34  
35   mpiSimulation::~mpiSimulation(){
36    
37 +  delete[] MolToProcMap;
38 +  delete[] MolComponentType;
39 +  delete[] AtomToProcMap;
40 +
41    delete mpiPlug;
42    // perhaps we should let fortran know the party is over.
43    
# Line 146 | Line 149 | int* mpiSimulation::divideLabor( void ){
149            MolToProcMap[i] = which_proc;
150            AtomsPerProc[which_proc] += add_atoms;
151            for (j = 0 ; j < add_atoms; j++ ) {
152 <            atomIndex++;
153 <            AtomToProcMap[atomIndex] = which_proc;
152 >            AtomToProcMap[atomIndex] = which_proc;
153 >            atomIndex++;
154            }
155            done = 1;
156            continue;
# Line 169 | Line 172 | int* mpiSimulation::divideLabor( void ){
172            MolToProcMap[i] = which_proc;
173            AtomsPerProc[which_proc] += add_atoms;
174            for (j = 0 ; j < add_atoms; j++ ) {
175 <            atomIndex++;
176 <            AtomToProcMap[atomIndex] = which_proc;
175 >            AtomToProcMap[atomIndex] = which_proc;
176 >            atomIndex++;
177            }
178            done = 1;
179            continue;
# Line 191 | Line 194 | int* mpiSimulation::divideLabor( void ){
194            MolToProcMap[i] = which_proc;
195            AtomsPerProc[which_proc] += add_atoms;
196            for (j = 0 ; j < add_atoms; j++ ) {
197 <            atomIndex++;
198 <            AtomToProcMap[atomIndex] = which_proc;
199 <          }
197 >            AtomToProcMap[atomIndex] = which_proc;
198 >            atomIndex++;
199 >           }
200            done = 1;
201            continue;
202          } else {
# Line 205 | Line 208 | int* mpiSimulation::divideLabor( void ){
208  
209      // Spray out this nonsense to all other processors:
210  
211 <    MPI::COMM_WORLD.Bcast(&MolToProcMap, mpiPlug->nMolGlobal,
211 >    MPI::COMM_WORLD.Bcast(MolToProcMap, mpiPlug->nMolGlobal,
212                            MPI_INT, 0);
213  
214 <    MPI::COMM_WORLD.Bcast(&AtomToProcMap, mpiPlug->nAtomsGlobal,
214 >    MPI::COMM_WORLD.Bcast(AtomToProcMap, mpiPlug->nAtomsGlobal,
215                            MPI_INT, 0);
216  
217 <    MPI::COMM_WORLD.Bcast(&MolComponentType, mpiPlug->nMolGlobal,
217 >    MPI::COMM_WORLD.Bcast(MolComponentType, mpiPlug->nMolGlobal,
218                            MPI_INT, 0);
219  
220 <    MPI::COMM_WORLD.Bcast(&AtomsPerProc, mpiPlug->numberProcessors,
220 >    MPI::COMM_WORLD.Bcast(AtomsPerProc, mpiPlug->numberProcessors,
221                            MPI_INT, 0);    
222    } else {
223  
224      // Listen to your marching orders from processor 0:
225      
226 <    MPI::COMM_WORLD.Bcast(&MolToProcMap, mpiPlug->nMolGlobal,
226 >    MPI::COMM_WORLD.Bcast(MolToProcMap, mpiPlug->nMolGlobal,
227                            MPI_INT, 0);
228      
229 <    MPI::COMM_WORLD.Bcast(&AtomToProcMap, mpiPlug->nAtomsGlobal,
229 >    MPI::COMM_WORLD.Bcast(AtomToProcMap, mpiPlug->nAtomsGlobal,
230                            MPI_INT, 0);
231  
232 <    MPI::COMM_WORLD.Bcast(&MolComponentType, mpiPlug->nMolGlobal,
232 >    MPI::COMM_WORLD.Bcast(MolComponentType, mpiPlug->nMolGlobal,
233                            MPI_INT, 0);
234      
235 <    MPI::COMM_WORLD.Bcast(&AtomsPerProc, mpiPlug->numberProcessors,
235 >    MPI::COMM_WORLD.Bcast(AtomsPerProc, mpiPlug->numberProcessors,
236                            MPI_INT, 0);
237    }
238  
# Line 282 | Line 285 | int* mpiSimulation::divideLabor( void ){
285    local_index = 0;
286    for (i = 0; i < mpiPlug->nAtomsGlobal; i++) {
287      if (AtomToProcMap[i] == mpiPlug->myNode) {
285 –      local_index++;
288        globalIndex[local_index] = i;
289 +      local_index++;
290      }
291    }
292  

Diff Legend

– Removed lines
+ Added lines
< Changed lines
> Changed lines