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root/group/trunk/OOPSE/libBASS/Globals.cpp
(Generate patch)

Comparing trunk/OOPSE/libBASS/Globals.cpp (file contents):
Revision 394 by gezelter, Mon Mar 24 21:55:34 2003 UTC vs.
Revision 855 by mmeineke, Thu Nov 6 22:01:37 2003 UTC

# Line 1 | Line 1
1 < #include <cstdlib>
2 < #include <cstdio>
3 < #include <cstring>
1 > #include <stdlib.h>
2 > #include <stdio.h>
3 > #include <string.h>
4  
5   #include "Globals.hpp"
6   #include "simError.h"
# Line 25 | Line 25
25   #define G_RUNTIME     6
26  
27   //optional parameters
28 < #define G_INITIALCONFIG 7
29 < #define G_FINALCONFIG   8
30 < #define G_NMOL          9
31 < #define G_DENSITY       10
32 < #define G_BOX           11
33 < #define G_BOXX          12
34 < #define G_BOXY          13
35 < #define G_BOXZ          14
36 < #define G_SAMPLETIME    15
37 < #define G_STATUSTIME    16
38 < #define G_ECR           17
39 < #define G_DIELECTRIC    18
40 < #define G_TEMPSET       19
41 < #define G_THERMALTIME   20
42 < #define G_USEPBC        21
43 < #define G_MIXINGRULE    22
44 < #define G_EST           23
45 < #define G_USERF         24
28 > #define G_INITIALCONFIG   7
29 > #define G_FINALCONFIG     8
30 > #define G_NMOL            9
31 > #define G_DENSITY        10
32 > #define G_BOX            11
33 > #define G_BOXX           12
34 > #define G_BOXY           13
35 > #define G_BOXZ           14
36 > #define G_SAMPLETIME     15
37 > #define G_STATUSTIME     16
38 > #define G_ECR            17
39 > #define G_DIELECTRIC     18
40 > #define G_TEMPSET        19
41 > #define G_THERMALTIME    20
42 > #define G_USEPBC         21
43 > #define G_MIXINGRULE     22
44 > #define G_EST            23
45 > #define G_USERF          24
46 > #define G_TARGETPRESSURE 25
47 > #define G_TAUTHERMOSTAT  26
48 > #define G_TAUBAROSTAT    27
49 > #define G_ZCONSTIME      28
50 > #define G_NZCONSTRAINTS  29
51 > #define G_ZCONSTOL       30
52 > #define G_ZCONSFORCEPOLICY 31
53 > #define G_SEED           32
54 > #define G_RESETTIME      33
55 > #define G_USEINITTIME    34
56 > #define G_USEINIT_XS_STATE 35
57 > #define G_ORTHOBOXTOLERANCE 36
58  
59  
60   Globals::Globals(){
61    
62    int i;
63 +
64 +  hash_size = 23;
65 +  hash_shift = 4;
66    
67    components = NULL;
68    
# Line 71 | Line 86 | Globals::Globals(){
86    addHash( "boxY",          G_BOXY );
87    addHash( "boxZ",          G_BOXZ );
88    addHash( "sampleTime",    G_SAMPLETIME );
89 +  addHash( "resetTime",     G_RESETTIME );
90    addHash( "statusTime",    G_STATUSTIME );
91    addHash( "electrostaticCutoffRadius",            G_ECR );
92    addHash( "dielectric",    G_DIELECTRIC );
# Line 80 | Line 96 | Globals::Globals(){
96    addHash( "usePeriodicBoundaryConditions",        G_USEPBC);
97    addHash( "electrostaticSkinThickness",           G_EST );
98    addHash( "useReactionField",                     G_USERF );
99 <  
99 >  addHash( "targetPressure",                       G_TARGETPRESSURE);
100 >  addHash( "tauThermostat",                        G_TAUTHERMOSTAT);
101 >  addHash( "tauBarostat",                          G_TAUBAROSTAT);
102 >  addHash( "zconsTime",                            G_ZCONSTIME);
103 >  addHash( "nZconstraints",                        G_NZCONSTRAINTS);
104 >  addHash( "zconsTol",                             G_ZCONSTOL);
105 >  addHash( "zconsForcePolicy",                     G_ZCONSFORCEPOLICY);
106 >  addHash( "seed",                                 G_SEED);
107 >  addHash( "useInitialTime",                       G_USEINITTIME);
108 >  addHash( "useInitialExtendedSystemState",        G_USEINIT_XS_STATE);
109 >  addHash( "orthoBoxTolerance",                    G_ORTHOBOXTOLERANCE);
110 >        
111 >        
112    // define some default values
113  
114    strcpy( mixingRule,"standard");  //default mixing rules to standard.
115    usePBC = 1; //default  periodic boundry conditions to on
116    useRF  = 0;
117 <  
117 >  useInitTime = 1; // default to pull init time from the init file
118 >  useInitXSstate = 1; // default to pull the extended state from the init file
119 >  orthoBoxTolerance = 1E-6;
120 >
121    have_force_field =  0;
122    have_n_components = 0;
123    have_target_temp =  0;
# Line 105 | Line 136 | Globals::Globals(){
136    have_box_z =          0;
137    have_sample_time =    0;
138    have_status_time =    0;
139 +  have_reset_time =     0;
140    have_thermal_time =   0;
141    have_ecr =            0;
142    have_dielectric =     0;
143    have_tempSet =        0;
144    have_est =            0;
145 < }
145 >  have_target_pressure =0;
146 >  have_q_mass =         0;
147 >  have_tau_thermostat = 0;
148 >  have_tau_barostat   = 0;
149 >  have_zcons_time     = 0;
150 >  have_n_zConstraints = 0;
151 >  have_zConstraints   = 0;
152 >  have_zcons_tol = 0;
153 >  have_seed = 0;
154  
155 + }
156 +
157   Globals::~Globals(){
158    int i;
159  
# Line 184 | Line 226 | int Globals::componentAssign( event* the_event ){
226    return 0;
227   }
228  
229 < int Globals::componentStartIndex( event* the_event ){
229 > int Globals::componentEnd( event* the_event ){
230  
231 <  current_component->startIndex( the_event->evt.si.array,
232 <                                 the_event->evt.si.n_elements );
231 >  the_event->err_msg = current_component->checkMe();
232 >  if( the_event->err_msg != NULL ) return 0;
233 >
234    return 1;
235   }
236  
237 < int Globals::componentEnd( event* the_event ){
237 > int Globals::newZconstraint( event* the_event ){
238 >  
239  
240 <  the_event->err_msg = current_component->checkMe();
240 >  int index = the_event->evt.blk_index;
241 >  char err[200];
242 >  current_zConstraint = new ZconStamp( index );
243 >  
244 >  have_zConstraints = 1;
245 >
246 >  if( have_n_zConstraints && index < n_zConstraints )
247 >    zConstraints[index] = current_zConstraint;
248 >  else{
249 >    if( have_n_zConstraints ){
250 >      sprintf( err, "Globals error, %d out of nZconstraints range",
251 >               index );
252 >      the_event->err_msg = strdup( err );
253 >      return 0;
254 >    }
255 >    else{
256 >      the_event->err_msg = strdup("Globals error, nZconstraints"
257 >                                  " not given before"
258 >                                  " first zConstraint declaration." );
259 >      return 0;
260 >    }
261 >  }  
262 >
263 >  return 1;
264 > }
265 >
266 >
267 >
268 > int Globals::zConstraintAssign( event* the_event ){
269 >
270 >  switch( the_event->evt.asmt.asmt_type ){
271 >    
272 >  case STRING:
273 >    return current_zConstraint->assignString( the_event->evt.asmt.lhs,
274 >                                              the_event->evt.asmt.rhs.sval,
275 >                                              &(the_event->err_msg));
276 >    break;
277 >    
278 >  case DOUBLE:
279 >    return current_zConstraint->assignDouble( the_event->evt.asmt.lhs,
280 >                                              the_event->evt.asmt.rhs.dval,
281 >                                              &(the_event->err_msg));
282 >    break;
283 >    
284 >  case INT:
285 >    return current_zConstraint->assignInt( the_event->evt.asmt.lhs,
286 >                                           the_event->evt.asmt.rhs.ival,
287 >                                           &(the_event->err_msg));
288 >    break;
289 >    
290 >  default:
291 >    the_event->err_msg = strdup( "Globals error. Invalid zConstraint"
292 >                                 " assignment type" );
293 >    return 0;
294 >    break;
295 >  }
296 >  return 0;
297 > }
298 >
299 > int Globals::zConstraintEnd( event* the_event ){
300 >
301 >  the_event->err_msg = current_zConstraint->checkMe();
302    if( the_event->err_msg != NULL ) return 0;
303  
304    return 1;
# Line 248 | Line 353 | int Globals::globalAssign( event* the_event ){
353          return 1;
354        }
355        break;
356 +
357 +    case G_NZCONSTRAINTS:
358 +      if( the_type == STRING ){
359 +        the_event->err_msg =
360 +          strdup("Global error. nZconstraints is not a double or an int.\n" );
361 +        return 0;
362 +      }
363        
364 +      else if( the_type == DOUBLE ){
365 +        n_zConstraints = (int)the_event->evt.asmt.rhs.dval;
366 +        zConstraints = new ZconStamp*[n_zConstraints];
367 +        have_n_zConstraints = 1;
368 +        return 1;
369 +      }
370 +      
371 +      else{
372 +        n_zConstraints = the_event->evt.asmt.rhs.ival;
373 +        zConstraints = new ZconStamp*[n_zConstraints];
374 +        have_n_zConstraints = 1;
375 +        return 1;
376 +      }
377 +      break;
378 +      
379      case G_TARGETTEMP:
380        switch( the_type ){
381          
# Line 277 | Line 404 | int Globals::globalAssign( event* the_event ){
404          break;
405        }
406        break;
407 +
408 +    case G_ORTHOBOXTOLERANCE:
409 +      switch( the_type ){
410 +        
411 +      case STRING:
412 +        the_event->err_msg =
413 +          strdup( "Global error. orthoBoxTolerance is not a double or int.\n" );
414 +        return 0;
415 +        break;
416 +        
417 +      case DOUBLE:
418 +        orthoBoxTolerance = the_event->evt.asmt.rhs.dval;
419 +        have_target_temp = 1;
420 +        return 1;
421 +        break;
422 +        
423 +      case INT:
424 +        orthoBoxTolerance = (double)the_event->evt.asmt.rhs.ival;
425 +        have_target_temp = 1;
426 +        return 1;
427 +        break;
428 +        
429 +      default:
430 +        the_event->err_msg =
431 +          strdup( "Global error.orthoBoxTolerance unrecognized.\n" );
432 +        return 0;
433 +        break;
434 +      }
435 +      break;
436        
437      case G_ENSEMBLE:
438        if( the_type == STRING ){
# Line 615 | Line 771 | int Globals::globalAssign( event* the_event ){
771        }
772        break;
773  
774 <   case G_THERMALTIME:
774 >    case G_RESETTIME:
775 >      switch( the_type ){
776 >        
777 >      case STRING:
778 >        the_event->err_msg =
779 >          strdup( "Global error. resetTime is not a double or int.\n" );
780 >        return 0;
781 >        break;
782 >        
783 >      case DOUBLE:
784 >        resetTime = the_event->evt.asmt.rhs.dval;
785 >        have_reset_time = 1;
786 >        return 1;
787 >        break;
788 >        
789 >      case INT:
790 >        resetTime = (double)the_event->evt.asmt.rhs.ival;
791 >        have_reset_time = 1;
792 >        return 1;
793 >        break;
794 >        
795 >      default:
796 >        the_event->err_msg =
797 >          strdup( "Global error. resetTime unrecognized.\n" );
798 >        return 0;
799 >        break;
800 >      }
801 >      break;
802 >
803 >    case G_THERMALTIME:
804        switch( the_type ){
805          
806        case STRING:
# Line 734 | Line 919 | int Globals::globalAssign( event* the_event ){
919      case G_TEMPSET:
920        if( the_type == STRING ){
921          
922 <        if( !strcmp( "true", the_event->evt.asmt.rhs.sval )) tempSet = 1;
923 <        else if( !strcmp( "false", the_event->evt.asmt.rhs.sval )) tempSet = 0;
922 >        if( !strcasecmp( "true", the_event->evt.asmt.rhs.sval )) tempSet = 1;
923 >        else if( !strcasecmp( "false", the_event->evt.asmt.rhs.sval )) tempSet = 0;
924          else{
925            the_event->err_msg =
926              strdup( "Global error. tempSet was not \"true\" or \"false\".\n" );
# Line 747 | Line 932 | int Globals::globalAssign( event* the_event ){
932        
933        the_event->err_msg =
934          strdup( "Global error. tempSet was not \"true\" or \"false\".\n" );
935 +      return 0;
936 +      break;
937 +
938 +    case G_USEINITTIME:
939 +      if( the_type == STRING ){
940 +        
941 +        if( !strcasecmp( "true", the_event->evt.asmt.rhs.sval )) useInitTime = 1;
942 +        else if( !strcasecmp( "false", the_event->evt.asmt.rhs.sval )) useInitTime = 0;
943 +        else{
944 +          the_event->err_msg =
945 +            strdup( "Global error. useInitTime was not \"true\" or \"false\".\n" );
946 +          return 0;
947 +        }
948 +        return 1;
949 +      }
950 +      
951 +      the_event->err_msg =
952 +        strdup( "Global error. useInitTime was not \"true\" or \"false\".\n" );
953        return 0;
954        break;
955 +
956 +    case G_USEINIT_XS_STATE:
957 +      if( the_type == STRING ){
958 +        
959 +        if( !strcasecmp( "true", the_event->evt.asmt.rhs.sval ))
960 +          useInitXSstate = 1;
961 +        else if( !strcasecmp( "false", the_event->evt.asmt.rhs.sval ))
962 +          useInitXSstate = 0;
963 +        else{
964 +          the_event->err_msg =
965 +            strdup( "Global error. useInitExtendedSystemState was not \"true\" or \"false\".\n" );
966 +          return 0;
967 +        }
968 +        return 1;
969 +      }
970        
971 +      the_event->err_msg =
972 +        strdup( "Global error. useInitExtendedSystemState was not \"true\" or \"false\".\n" );
973 +      return 0;
974 +      break;
975 +      
976      case G_USEPBC:
977        if( the_type == STRING ){
978          
979 <        if( !strcmp( "true", the_event->evt.asmt.rhs.sval )) usePBC = 1;
980 <        else if( !strcmp( "false", the_event->evt.asmt.rhs.sval )) usePBC = 0;
979 >        if( !strcasecmp( "true", the_event->evt.asmt.rhs.sval )) usePBC = 1;
980 >        else if( !strcasecmp( "false", the_event->evt.asmt.rhs.sval )) usePBC = 0;
981          else{
982            the_event->err_msg =
983              strdup( "Global error. usePeriodicBoundaryConditions was not \"true\" or \"false\".\n" );
# Line 771 | Line 994 | int Globals::globalAssign( event* the_event ){
994      case G_USERF:
995        if( the_type == STRING ){
996          
997 <        if( !strcmp( "true", the_event->evt.asmt.rhs.sval )) useRF = 1;
998 <        else if( !strcmp( "false", the_event->evt.asmt.rhs.sval )) useRF = 0;
997 >        if( !strcasecmp( "true", the_event->evt.asmt.rhs.sval )) useRF = 1;
998 >        else if( !strcasecmp( "false", the_event->evt.asmt.rhs.sval )) useRF = 0;
999          else{
1000            the_event->err_msg =
1001              strdup( "Global error. useReactionField was not \"true\" or \"false\".\n" );
# Line 786 | Line 1009 | int Globals::globalAssign( event* the_event ){
1009        return 0;
1010        break;
1011  
1012 +    case G_TARGETPRESSURE:
1013 +      switch( the_type ){
1014 +        
1015 +      case STRING:
1016 +        the_event->err_msg =
1017 +          strdup( "Global error. targetPressure is not a double or int.\n" );
1018 +        return 0;
1019 +        break;
1020 +        
1021 +      case DOUBLE:
1022 +        target_pressure = the_event->evt.asmt.rhs.dval;
1023 +        have_target_pressure = 1;
1024 +        return 1;
1025 +        break;
1026 +        
1027 +      case INT:
1028 +        target_pressure = (double)the_event->evt.asmt.rhs.ival;
1029 +        have_target_pressure = 1;
1030 +        return 1;
1031 +        break;
1032 +        
1033 +      default:
1034 +        the_event->err_msg =
1035 +          strdup( "Global error. targetPressure unrecognized.\n" );
1036 +        return 0;
1037 +        break;
1038 +      }
1039 +      break;
1040  
1041 +    case G_TAUTHERMOSTAT:
1042 +      switch( the_type ){
1043 +        
1044 +      case STRING:
1045 +        the_event->err_msg =
1046 +          strdup( "Global error. tauThermostat is not a double or int.\n" );
1047 +        return 0;
1048 +        break;
1049 +        
1050 +      case DOUBLE:
1051 +        tau_thermostat = the_event->evt.asmt.rhs.dval;
1052 +        have_tau_thermostat = 1;
1053 +        return 1;
1054 +        break;
1055 +        
1056 +      case INT:
1057 +        tau_thermostat = (double)the_event->evt.asmt.rhs.ival;
1058 +        have_tau_thermostat = 1;
1059 +        return 1;
1060 +        break;
1061 +        
1062 +      default:
1063 +        the_event->err_msg =
1064 +          strdup( "Global error. tauThermostat unrecognized.\n" );
1065 +        return 0;
1066 +        break;
1067 +      }
1068 +      break;
1069 +
1070 +    case G_TAUBAROSTAT:
1071 +      switch( the_type ){
1072 +        
1073 +      case STRING:
1074 +        the_event->err_msg =
1075 +          strdup( "Global error. tauBarostat is not a double or int.\n" );
1076 +        return 0;
1077 +        break;
1078 +        
1079 +      case DOUBLE:
1080 +        tau_barostat = the_event->evt.asmt.rhs.dval;
1081 +        have_tau_barostat = 1;
1082 +        return 1;
1083 +        break;
1084 +        
1085 +      case INT:
1086 +        tau_barostat = (double)the_event->evt.asmt.rhs.ival;
1087 +        have_tau_barostat = 1;
1088 +        return 1;
1089 +        break;
1090 +        
1091 +      default:
1092 +        the_event->err_msg =
1093 +          strdup( "Global error. tauBarostat unrecognized.\n" );
1094 +        return 0;
1095 +        break;
1096 +      }
1097 +      break;
1098 +      
1099 +    case G_ZCONSTIME:
1100 +      switch( the_type ){
1101 +        
1102 +      case STRING:
1103 +        the_event->err_msg =
1104 +          strdup( "Global error. zcons_time is not a double or int.\n" );
1105 +        return 0;
1106 +        break;
1107 +        
1108 +      case DOUBLE:
1109 +        zcons_time = the_event->evt.asmt.rhs.dval;
1110 +        have_zcons_time = 1;
1111 +        return 1;
1112 +        break;
1113 +        
1114 +      case INT:
1115 +        zcons_time = (double)the_event->evt.asmt.rhs.ival;
1116 +        have_zcons_time = 1;
1117 +        return 1;
1118 +        break;
1119 +        
1120 +      default:
1121 +        the_event->err_msg =
1122 +          strdup( "Global error. zcons_time unrecognized.\n" );
1123 +        return 0;
1124 +        break;
1125 +      }
1126 +      break;
1127 +
1128 +    case G_ZCONSTOL:
1129 +      switch( the_type ){
1130 +        
1131 +      case STRING:
1132 +        the_event->err_msg =
1133 +          strdup( "Global error. zcons_tol is not a double or int.\n" );
1134 +        return 0;
1135 +        break;
1136 +        
1137 +      case DOUBLE:
1138 +        zcons_tol = the_event->evt.asmt.rhs.dval;
1139 +        have_zcons_tol = 1;
1140 +        return 1;
1141 +        break;
1142 +        
1143 +      case INT:
1144 +        zcons_tol = (double)the_event->evt.asmt.rhs.ival;
1145 +        have_zcons_tol = 1;
1146 +        return 1;
1147 +        break;
1148 +        
1149 +      default:
1150 +        the_event->err_msg =
1151 +          strdup( "Global error. zcons_ol unrecognized.\n" );
1152 +        return 0;
1153 +        break;
1154 +      }
1155 +      break;
1156 +  
1157 +    case G_ZCONSFORCEPOLICY:
1158 +      switch( the_type ){
1159 +        
1160 +      case STRING:
1161 +   strcpy(zconsForcePolicy, the_event->evt.asmt.rhs.sval);
1162 +
1163 +   for(int i = 0; zconsForcePolicy[i] != '\0'; i++)
1164 +        {
1165 +      zconsForcePolicy[i] = toupper(zconsForcePolicy[i]);
1166 +   }
1167 +        have_zcons_force_policy = 1;
1168 +   return 1;
1169 +        break;
1170 +        
1171 +      case DOUBLE:
1172 +        the_event->err_msg =
1173 +          strdup( "Global error. zconsForcePolicy is not a double or int.\n" );
1174 +        return 0;
1175 +        break;
1176 +        
1177 +      case INT:
1178 +        the_event->err_msg =
1179 +          strdup( "Global error. zconsForcePolicy is not a double or int.\n" );
1180 +        return 0;
1181 +        break;
1182 +        
1183 +      default:
1184 +        the_event->err_msg =
1185 +          strdup( "Global error. zconsForcePolicy unrecognized.\n" );
1186 +        return 0;
1187 +        break;
1188 +      }
1189 +      break;
1190 +      // add more token cases here.
1191 +    case G_SEED:
1192 +      switch( the_type ){
1193 +        
1194 +      case STRING:
1195 +   the_event->err_msg =
1196 +          strdup( "Global error. seed is not a string.\n" );
1197 +        return 0;
1198 +   return 0;
1199 +        break;
1200 +        
1201 +      case DOUBLE:
1202 +   have_seed = 1;
1203 +   seed = (int)the_event->evt.asmt.rhs.dval;
1204 +        return 1;
1205 +        break;
1206 +        
1207 +      case INT:
1208 +   have_seed = 1;
1209 +   seed =  the_event->evt.asmt.rhs.ival ;
1210 +        return 1;
1211 +        break;
1212 +        
1213 +      default:
1214 +        the_event->err_msg =
1215 +          strdup( "Global error. seed unrecognized.\n" );
1216 +        return 0;
1217 +        break;
1218 +      }
1219 +      break;
1220 +      // add more token cases here.
1221 +
1222      }
1223    }
1224    

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