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root/group/trunk/OOPSE/libBASS/Globals.cpp
(Generate patch)

Comparing trunk/OOPSE/libBASS/Globals.cpp (file contents):
Revision 378 by mmeineke, Fri Mar 21 17:42:12 2003 UTC vs.
Revision 811 by mmeineke, Tue Oct 21 19:33:19 2003 UTC

# Line 25 | Line 25
25   #define G_RUNTIME     6
26  
27   //optional parameters
28 < #define G_INITIALCONFIG 7
29 < #define G_FINALCONFIG   8
30 < #define G_NMOL          9
31 < #define G_DENSITY       10
32 < #define G_BOX           11
33 < #define G_BOXX          12
34 < #define G_BOXY          13
35 < #define G_BOXZ          14
36 < #define G_SAMPLETIME    15
37 < #define G_STATUSTIME    16
38 < #define G_RRF           17
39 < #define G_DIELECTRIC    18
40 < #define G_TEMPSET       19
41 < #define G_THERMALTIME   20
42 < #define G_USEPBC 21
43 < #define G_MIXINGRULE 22
28 > #define G_INITIALCONFIG   7
29 > #define G_FINALCONFIG     8
30 > #define G_NMOL            9
31 > #define G_DENSITY        10
32 > #define G_BOX            11
33 > #define G_BOXX           12
34 > #define G_BOXY           13
35 > #define G_BOXZ           14
36 > #define G_SAMPLETIME     15
37 > #define G_STATUSTIME     16
38 > #define G_ECR            17
39 > #define G_DIELECTRIC     18
40 > #define G_TEMPSET        19
41 > #define G_THERMALTIME    20
42 > #define G_USEPBC         21
43 > #define G_MIXINGRULE     22
44 > #define G_EST            23
45 > #define G_USERF          24
46 > #define G_TARGETPRESSURE 25
47 > #define G_TAUTHERMOSTAT  26
48 > #define G_TAUBAROSTAT    27
49 > #define G_ZCONSTIME      28
50 > #define G_NZCONSTRAINTS  29
51 > #define G_ZCONSTOL       30
52 > #define G_ZCONSFORCEPOLICY 31
53 > #define G_SEED           32
54 > #define G_RESETTIME      33
55 > #define G_USEINITTIME    34
56  
45 –
57   Globals::Globals(){
58    
59    int i;
60 +
61 +  hash_size = 23;
62 +  hash_shift = 4;
63    
64    components = NULL;
65    
# Line 69 | Line 83 | Globals::Globals(){
83    addHash( "boxY",          G_BOXY );
84    addHash( "boxZ",          G_BOXZ );
85    addHash( "sampleTime",    G_SAMPLETIME );
86 +  addHash( "resetTime",     G_RESETTIME );
87    addHash( "statusTime",    G_STATUSTIME );
88 <  addHash( "rRF",           G_RRF );
88 >  addHash( "electrostaticCutoffRadius",            G_ECR );
89    addHash( "dielectric",    G_DIELECTRIC );
90    addHash( "tempSet",       G_TEMPSET );
91    addHash( "thermalTime",   G_THERMALTIME );
92    addHash( "mixingRule",    G_MIXINGRULE);
93 <  addHash( "periodicBox",   G_USEPBC);
94 <  
93 >  addHash( "usePeriodicBoundaryConditions",        G_USEPBC);
94 >  addHash( "electrostaticSkinThickness",           G_EST );
95 >  addHash( "useReactionField",                     G_USERF );
96 >  addHash( "targetPressure",                       G_TARGETPRESSURE);
97 >  addHash( "tauThermostat",                        G_TAUTHERMOSTAT);
98 >  addHash( "tauBarostat",                          G_TAUBAROSTAT);
99 >  addHash( "zconsTime",                            G_ZCONSTIME);
100 >  addHash( "nZconstraints",                        G_NZCONSTRAINTS);
101 >  addHash( "zconsTol",                             G_ZCONSTOL);
102 >  addHash( "zconsForcePolicy",                     G_ZCONSFORCEPOLICY);
103 >  addHash( "seed",                                 G_SEED);
104 >  addHash( "useInitTime",                          G_USEINITTIME),
105 >        
106 >        
107    // define some default values
108  
109    strcpy( mixingRule,"standard");  //default mixing rules to standard.
110    usePBC = 1; //default  periodic boundry conditions to on
111 +  useRF  = 0;
112 +  useInitTime = 1; // default to pull init time from the init file
113    
85 –
114    have_force_field =  0;
115    have_n_components = 0;
116    have_target_temp =  0;
# Line 101 | Line 129 | Globals::Globals(){
129    have_box_z =          0;
130    have_sample_time =    0;
131    have_status_time =    0;
132 +  have_reset_time =     0;
133    have_thermal_time =   0;
134 <  have_rrf =            0;
134 >  have_ecr =            0;
135    have_dielectric =     0;
136    have_tempSet =        0;
137 < }
137 >  have_est =            0;
138 >  have_target_pressure =0;
139 >  have_q_mass =         0;
140 >  have_tau_thermostat = 0;
141 >  have_tau_barostat   = 0;
142 >  have_zcons_time     = 0;
143 >  have_n_zConstraints = 0;
144 >  have_zConstraints   = 0;
145 >  have_zcons_tol = 0;
146 >  have_seed = 0;
147  
148 + }
149 +
150   Globals::~Globals(){
151    int i;
152  
# Line 179 | Line 219 | int Globals::componentAssign( event* the_event ){
219    return 0;
220   }
221  
222 < int Globals::componentStartIndex( event* the_event ){
222 > int Globals::componentEnd( event* the_event ){
223  
224 <  current_component->startIndex( the_event->evt.si.array,
225 <                                 the_event->evt.si.n_elements );
224 >  the_event->err_msg = current_component->checkMe();
225 >  if( the_event->err_msg != NULL ) return 0;
226 >
227    return 1;
228   }
229  
230 < int Globals::componentEnd( event* the_event ){
230 > int Globals::newZconstraint( event* the_event ){
231 >  
232  
233 <  the_event->err_msg = current_component->checkMe();
233 >  int index = the_event->evt.blk_index;
234 >  char err[200];
235 >  current_zConstraint = new ZconStamp( index );
236 >  
237 >  have_zConstraints = 1;
238 >
239 >  if( have_n_zConstraints && index < n_zConstraints )
240 >    zConstraints[index] = current_zConstraint;
241 >  else{
242 >    if( have_n_zConstraints ){
243 >      sprintf( err, "Globals error, %d out of nZconstraints range",
244 >               index );
245 >      the_event->err_msg = strdup( err );
246 >      return 0;
247 >    }
248 >    else{
249 >      the_event->err_msg = strdup("Globals error, nZconstraints"
250 >                                  " not given before"
251 >                                  " first zConstraint declaration." );
252 >      return 0;
253 >    }
254 >  }  
255 >
256 >  return 1;
257 > }
258 >
259 >
260 >
261 > int Globals::zConstraintAssign( event* the_event ){
262 >
263 >  switch( the_event->evt.asmt.asmt_type ){
264 >    
265 >  case STRING:
266 >    return current_zConstraint->assignString( the_event->evt.asmt.lhs,
267 >                                              the_event->evt.asmt.rhs.sval,
268 >                                              &(the_event->err_msg));
269 >    break;
270 >    
271 >  case DOUBLE:
272 >    return current_zConstraint->assignDouble( the_event->evt.asmt.lhs,
273 >                                              the_event->evt.asmt.rhs.dval,
274 >                                              &(the_event->err_msg));
275 >    break;
276 >    
277 >  case INT:
278 >    return current_zConstraint->assignInt( the_event->evt.asmt.lhs,
279 >                                           the_event->evt.asmt.rhs.ival,
280 >                                           &(the_event->err_msg));
281 >    break;
282 >    
283 >  default:
284 >    the_event->err_msg = strdup( "Globals error. Invalid zConstraint"
285 >                                 " assignment type" );
286 >    return 0;
287 >    break;
288 >  }
289 >  return 0;
290 > }
291 >
292 > int Globals::zConstraintEnd( event* the_event ){
293 >
294 >  the_event->err_msg = current_zConstraint->checkMe();
295    if( the_event->err_msg != NULL ) return 0;
296  
297    return 1;
# Line 240 | Line 343 | int Globals::globalAssign( event* the_event ){
343          n_components = the_event->evt.asmt.rhs.ival;
344          components = new Component*[n_components];
345          have_n_components = 1;
346 +        return 1;
347 +      }
348 +      break;
349 +
350 +    case G_NZCONSTRAINTS:
351 +      if( the_type == STRING ){
352 +        the_event->err_msg =
353 +          strdup("Global error. nZconstraints is not a double or an int.\n" );
354 +        return 0;
355 +      }
356 +      
357 +      else if( the_type == DOUBLE ){
358 +        n_zConstraints = (int)the_event->evt.asmt.rhs.dval;
359 +        zConstraints = new ZconStamp*[n_zConstraints];
360 +        have_n_zConstraints = 1;
361          return 1;
362        }
363 +      
364 +      else{
365 +        n_zConstraints = the_event->evt.asmt.rhs.ival;
366 +        zConstraints = new ZconStamp*[n_zConstraints];
367 +        have_n_zConstraints = 1;
368 +        return 1;
369 +      }
370        break;
371        
372      case G_TARGETTEMP:
# Line 610 | Line 735 | int Globals::globalAssign( event* the_event ){
735        }
736        break;
737  
738 <   case G_THERMALTIME:
738 >    case G_RESETTIME:
739 >      switch( the_type ){
740 >        
741 >      case STRING:
742 >        the_event->err_msg =
743 >          strdup( "Global error. resetTime is not a double or int.\n" );
744 >        return 0;
745 >        break;
746 >        
747 >      case DOUBLE:
748 >        resetTime = the_event->evt.asmt.rhs.dval;
749 >        have_reset_time = 1;
750 >        return 1;
751 >        break;
752 >        
753 >      case INT:
754 >        resetTime = (double)the_event->evt.asmt.rhs.ival;
755 >        have_reset_time = 1;
756 >        return 1;
757 >        break;
758 >        
759 >      default:
760 >        the_event->err_msg =
761 >          strdup( "Global error. resetTime unrecognized.\n" );
762 >        return 0;
763 >        break;
764 >      }
765 >      break;
766 >
767 >    case G_THERMALTIME:
768        switch( the_type ){
769          
770        case STRING:
# Line 639 | Line 793 | int Globals::globalAssign( event* the_event ){
793        }
794        break;
795        
796 <    case G_RRF:
796 >    case G_ECR:
797        switch( the_type ){
798          
799        case STRING:
800          the_event->err_msg =
801 <          strdup( "Global error. rRF is not a double or int.\n" );
801 >          strdup( "Global error. electrostaticCutoffRadius is not a double or int.\n" );
802          return 0;
803          break;
804          
805        case DOUBLE:
806 <        rRF = the_event->evt.asmt.rhs.dval;
807 <        have_rrf = 1;
806 >        ecr = the_event->evt.asmt.rhs.dval;
807 >        have_ecr = 1;
808          return 1;
809          break;
810          
811        case INT:
812 <        rRF = (double)the_event->evt.asmt.rhs.ival;
813 <        have_rrf = 1;
812 >        ecr = (double)the_event->evt.asmt.rhs.ival;
813 >        have_ecr = 1;
814          return 1;
815          break;
816          
817        default:
818          the_event->err_msg =
819 <          strdup( "Global error. rRF unrecognized.\n" );
819 >          strdup( "Global error. electrostaticCutoffRadius unrecognized.\n" );
820          return 0;
821          break;
822        }
823        break;
824 +
825 +    case G_EST:
826 +      switch( the_type ){
827 +        
828 +      case STRING:
829 +        the_event->err_msg =
830 +          strdup( "Global error. electrostaticSkinThickness is not a double or int.\n" );
831 +        return 0;
832 +        break;
833 +        
834 +      case DOUBLE:
835 +        est = the_event->evt.asmt.rhs.dval;
836 +        have_est = 1;
837 +        return 1;
838 +        break;
839 +        
840 +      case INT:
841 +        est = (double)the_event->evt.asmt.rhs.ival;
842 +        have_est = 1;
843 +        return 1;
844 +        break;
845 +        
846 +      default:
847 +        the_event->err_msg =
848 +          strdup( "Global error. electrostaticSkinThickness unrecognized.\n" );
849 +        return 0;
850 +        break;
851 +      }
852 +      break;
853        
854      case G_DIELECTRIC:
855        switch( the_type ){
# Line 700 | Line 883 | int Globals::globalAssign( event* the_event ){
883      case G_TEMPSET:
884        if( the_type == STRING ){
885          
886 <        if( !strcmp( "true", the_event->evt.asmt.rhs.sval )) tempSet = 1;
887 <        else if( !strcmp( "false", the_event->evt.asmt.rhs.sval )) tempSet = 0;
886 >        if( !strcasecmp( "true", the_event->evt.asmt.rhs.sval )) tempSet = 1;
887 >        else if( !strcasecmp( "false", the_event->evt.asmt.rhs.sval )) tempSet = 0;
888          else{
889            the_event->err_msg =
890              strdup( "Global error. tempSet was not \"true\" or \"false\".\n" );
# Line 715 | Line 898 | int Globals::globalAssign( event* the_event ){
898          strdup( "Global error. tempSet was not \"true\" or \"false\".\n" );
899        return 0;
900        break;
901 +
902 +    case G_USEINITTIME:
903 +      if( the_type == STRING ){
904 +        
905 +        if( !strcasecmp( "true", the_event->evt.asmt.rhs.sval )) useInitTime = 1;
906 +        else if( !strcasecmp( "false", the_event->evt.asmt.rhs.sval )) useInitTime = 0;
907 +        else{
908 +          the_event->err_msg =
909 +            strdup( "Global error. useInitTime was not \"true\" or \"false\".\n" );
910 +          return 0;
911 +        }
912 +        return 1;
913 +      }
914        
915 +      the_event->err_msg =
916 +        strdup( "Global error. useInitTime was not \"true\" or \"false\".\n" );
917 +      return 0;
918 +      break;
919 +      
920      case G_USEPBC:
921        if( the_type == STRING ){
922          
923 <        if( !strcmp( "true", the_event->evt.asmt.rhs.sval )) usePBC = 1;
924 <        else if( !strcmp( "false", the_event->evt.asmt.rhs.sval )) usePBC = 0;
923 >        if( !strcasecmp( "true", the_event->evt.asmt.rhs.sval )) usePBC = 1;
924 >        else if( !strcasecmp( "false", the_event->evt.asmt.rhs.sval )) usePBC = 0;
925          else{
926            the_event->err_msg =
927 <            strdup( "Global error. periodicBoundryConditions was not \"true\" or \"false\".\n" );
927 >            strdup( "Global error. usePeriodicBoundaryConditions was not \"true\" or \"false\".\n" );
928            return 0;
929          }
930          return 1;
931        }
932        
933        the_event->err_msg =
934 <        strdup( "Global error. tempSet was not \"true\" or \"false\".\n" );
934 >        strdup( "Global error. usePeriodicBoundaryConditions was not \"true\" or \"false\".\n" );
935        return 0;
936 +      break;
937 +
938 +    case G_USERF:
939 +      if( the_type == STRING ){
940 +        
941 +        if( !strcasecmp( "true", the_event->evt.asmt.rhs.sval )) useRF = 1;
942 +        else if( !strcasecmp( "false", the_event->evt.asmt.rhs.sval )) useRF = 0;
943 +        else{
944 +          the_event->err_msg =
945 +            strdup( "Global error. useReactionField was not \"true\" or \"false\".\n" );
946 +          return 0;
947 +        }
948 +        return 1;
949 +      }
950 +      
951 +      the_event->err_msg =
952 +        strdup( "Global error. useReactionField was not \"true\" or \"false\".\n" );
953 +      return 0;
954 +      break;
955 +
956 +    case G_TARGETPRESSURE:
957 +      switch( the_type ){
958 +        
959 +      case STRING:
960 +        the_event->err_msg =
961 +          strdup( "Global error. targetPressure is not a double or int.\n" );
962 +        return 0;
963 +        break;
964 +        
965 +      case DOUBLE:
966 +        target_pressure = the_event->evt.asmt.rhs.dval;
967 +        have_target_pressure = 1;
968 +        return 1;
969 +        break;
970 +        
971 +      case INT:
972 +        target_pressure = (double)the_event->evt.asmt.rhs.ival;
973 +        have_target_pressure = 1;
974 +        return 1;
975 +        break;
976 +        
977 +      default:
978 +        the_event->err_msg =
979 +          strdup( "Global error. targetPressure unrecognized.\n" );
980 +        return 0;
981 +        break;
982 +      }
983 +      break;
984 +
985 +    case G_TAUTHERMOSTAT:
986 +      switch( the_type ){
987 +        
988 +      case STRING:
989 +        the_event->err_msg =
990 +          strdup( "Global error. tauThermostat is not a double or int.\n" );
991 +        return 0;
992 +        break;
993 +        
994 +      case DOUBLE:
995 +        tau_thermostat = the_event->evt.asmt.rhs.dval;
996 +        have_tau_thermostat = 1;
997 +        return 1;
998 +        break;
999 +        
1000 +      case INT:
1001 +        tau_thermostat = (double)the_event->evt.asmt.rhs.ival;
1002 +        have_tau_thermostat = 1;
1003 +        return 1;
1004 +        break;
1005 +        
1006 +      default:
1007 +        the_event->err_msg =
1008 +          strdup( "Global error. tauThermostat unrecognized.\n" );
1009 +        return 0;
1010 +        break;
1011 +      }
1012 +      break;
1013 +
1014 +    case G_TAUBAROSTAT:
1015 +      switch( the_type ){
1016 +        
1017 +      case STRING:
1018 +        the_event->err_msg =
1019 +          strdup( "Global error. tauBarostat is not a double or int.\n" );
1020 +        return 0;
1021 +        break;
1022 +        
1023 +      case DOUBLE:
1024 +        tau_barostat = the_event->evt.asmt.rhs.dval;
1025 +        have_tau_barostat = 1;
1026 +        return 1;
1027 +        break;
1028 +        
1029 +      case INT:
1030 +        tau_barostat = (double)the_event->evt.asmt.rhs.ival;
1031 +        have_tau_barostat = 1;
1032 +        return 1;
1033 +        break;
1034 +        
1035 +      default:
1036 +        the_event->err_msg =
1037 +          strdup( "Global error. tauBarostat unrecognized.\n" );
1038 +        return 0;
1039 +        break;
1040 +      }
1041        break;
1042 +      
1043 +    case G_ZCONSTIME:
1044 +      switch( the_type ){
1045 +        
1046 +      case STRING:
1047 +        the_event->err_msg =
1048 +          strdup( "Global error. zcons_time is not a double or int.\n" );
1049 +        return 0;
1050 +        break;
1051 +        
1052 +      case DOUBLE:
1053 +        zcons_time = the_event->evt.asmt.rhs.dval;
1054 +        have_zcons_time = 1;
1055 +        return 1;
1056 +        break;
1057 +        
1058 +      case INT:
1059 +        zcons_time = (double)the_event->evt.asmt.rhs.ival;
1060 +        have_zcons_time = 1;
1061 +        return 1;
1062 +        break;
1063 +        
1064 +      default:
1065 +        the_event->err_msg =
1066 +          strdup( "Global error. zcons_time unrecognized.\n" );
1067 +        return 0;
1068 +        break;
1069 +      }
1070 +      break;
1071 +
1072 +    case G_ZCONSTOL:
1073 +      switch( the_type ){
1074 +        
1075 +      case STRING:
1076 +        the_event->err_msg =
1077 +          strdup( "Global error. zcons_tol is not a double or int.\n" );
1078 +        return 0;
1079 +        break;
1080 +        
1081 +      case DOUBLE:
1082 +        zcons_tol = the_event->evt.asmt.rhs.dval;
1083 +        have_zcons_tol = 1;
1084 +        return 1;
1085 +        break;
1086 +        
1087 +      case INT:
1088 +        zcons_tol = (double)the_event->evt.asmt.rhs.ival;
1089 +        have_zcons_tol = 1;
1090 +        return 1;
1091 +        break;
1092 +        
1093 +      default:
1094 +        the_event->err_msg =
1095 +          strdup( "Global error. zcons_ol unrecognized.\n" );
1096 +        return 0;
1097 +        break;
1098 +      }
1099 +      break;
1100 +  
1101 +    case G_ZCONSFORCEPOLICY:
1102 +      switch( the_type ){
1103 +        
1104 +      case STRING:
1105 +   strcpy(zconsForcePolicy, the_event->evt.asmt.rhs.sval);
1106 +
1107 +   for(int i = 0; zconsForcePolicy[i] != '\0'; i++)
1108 +        {
1109 +      zconsForcePolicy[i] = toupper(zconsForcePolicy[i]);
1110 +   }
1111 +        have_zcons_force_policy = 1;
1112 +   return 1;
1113 +        break;
1114 +        
1115 +      case DOUBLE:
1116 +        the_event->err_msg =
1117 +          strdup( "Global error. zconsForcePolicy is not a double or int.\n" );
1118 +        return 0;
1119 +        break;
1120 +        
1121 +      case INT:
1122 +        the_event->err_msg =
1123 +          strdup( "Global error. zconsForcePolicy is not a double or int.\n" );
1124 +        return 0;
1125 +        break;
1126 +        
1127 +      default:
1128 +        the_event->err_msg =
1129 +          strdup( "Global error. zconsForcePolicy unrecognized.\n" );
1130 +        return 0;
1131 +        break;
1132 +      }
1133 +      break;
1134 +      // add more token cases here.
1135 +    case G_SEED:
1136 +      switch( the_type ){
1137 +        
1138 +      case STRING:
1139 +   the_event->err_msg =
1140 +          strdup( "Global error. seed is not a string.\n" );
1141 +        return 0;
1142 +   return 0;
1143 +        break;
1144 +        
1145 +      case DOUBLE:
1146 +   have_seed = 1;
1147 +   seed = (int)the_event->evt.asmt.rhs.dval;
1148 +        return 1;
1149 +        break;
1150 +        
1151 +      case INT:
1152 +   have_seed = 1;
1153 +   seed =  the_event->evt.asmt.rhs.ival ;
1154 +        return 1;
1155 +        break;
1156 +        
1157 +      default:
1158 +        the_event->err_msg =
1159 +          strdup( "Global error. seed unrecognized.\n" );
1160 +        return 0;
1161 +        break;
1162 +      }
1163 +      break;
1164 +      // add more token cases here.
1165 +
1166      }
1167    }
1168    

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