| 765 | 
  | 
                "\tfor the cutoffRadius.\n"); | 
| 766 | 
  | 
            painCave.isFatal = 0; | 
| 767 | 
  | 
            simError(); | 
| 768 | 
< | 
            rcut_ = 15.0; | 
| 768 | 
> | 
            rcut = 15.0; | 
| 769 | 
  | 
        } else{ | 
| 770 | 
< | 
            rcut_ = simParams_->getRcut(); | 
| 770 | 
> | 
            rcut = simParams_->getRcut(); | 
| 771 | 
  | 
        } | 
| 772 | 
  | 
 | 
| 773 | 
  | 
        if (!simParams_->haveRsw()){ | 
| 777 | 
  | 
                "\t0.95 * cutoffRadius for the switchingRadius\n"); | 
| 778 | 
  | 
            painCave.isFatal = 0; | 
| 779 | 
  | 
            simError(); | 
| 780 | 
< | 
            rsw_ = 0.95 * rcut_; | 
| 780 | 
> | 
            rsw = 0.95 * rcut; | 
| 781 | 
  | 
        } else{ | 
| 782 | 
< | 
            rsw_ = simParams_->getRsw(); | 
| 782 | 
> | 
            rsw = simParams_->getRsw(); | 
| 783 | 
  | 
        } | 
| 784 | 
  | 
 | 
| 785 | 
  | 
    } else { | 
| 787 | 
  | 
        //meta-data file, the maximum cutoff radius calculated from forcefiled will be used | 
| 788 | 
  | 
         | 
| 789 | 
  | 
        if (simParams_->haveRcut()) { | 
| 790 | 
< | 
            rcut_ = simParams_->getRcut(); | 
| 790 | 
> | 
            rcut = simParams_->getRcut(); | 
| 791 | 
  | 
        } else { | 
| 792 | 
  | 
            //set cutoff radius to the maximum cutoff radius based on atom types in the whole system | 
| 793 | 
< | 
            rcut_ = calcMaxCutoffRadius(); | 
| 793 | 
> | 
            rcut = calcMaxCutoffRadius(); | 
| 794 | 
  | 
        } | 
| 795 | 
  | 
 | 
| 796 | 
  | 
        if (simParams_->haveRsw()) { | 
| 797 | 
< | 
            rsw_  = simParams_->getRsw(); | 
| 797 | 
> | 
            rsw  = simParams_->getRsw(); | 
| 798 | 
  | 
        } else { | 
| 799 | 
< | 
            rsw_ = rcut_; | 
| 799 | 
> | 
            rsw = rcut; | 
| 800 | 
  | 
        } | 
| 801 | 
  | 
     | 
| 802 | 
  | 
    } |