| 119 | 
  | 
            //} | 
| 120 | 
  | 
            if (lookingAtDecimal((tokCommand & Token::negnums) != 0)) { | 
| 121 | 
  | 
                float value = lexi_cast<float>(script.substr(ichToken, cchToken));         | 
| 122 | 
– | 
                std::cout << "encount an decimal: " << value << std::endl; | 
| 122 | 
  | 
                ltoken.push_back(Token(Token::decimal, boost::any(value))); | 
| 123 | 
  | 
                continue; | 
| 124 | 
  | 
            } | 
| 125 | 
  | 
            if (lookingAtInteger((tokCommand & Token::negnums) != 0)) { | 
| 126 | 
  | 
 | 
| 127 | 
  | 
                int val = lexi_cast<int>(script.substr(ichToken, cchToken)); | 
| 129 | 
– | 
                std::cout << "encount an integer: " << val << std::endl; | 
| 128 | 
  | 
                ltoken.push_back(Token(Token::integer,   boost::any(val))); | 
| 129 | 
  | 
                continue; | 
| 130 | 
  | 
            } | 
| 242 | 
  | 
      previousCharBackslash = ch == '\\' ? !previousCharBackslash : false; | 
| 243 | 
  | 
    } | 
| 244 | 
  | 
    cchToken = ichT - ichToken; | 
| 247 | 
– | 
 | 
| 245 | 
  | 
 | 
| 249 | 
– | 
    std::cout << "lookingAtString: encount " << script.substr(ichToken, cchToken) << std::endl;  | 
| 246 | 
  | 
    return true; | 
| 247 | 
  | 
  } | 
| 248 | 
  | 
 | 
| 340 | 
  | 
        return false; | 
| 341 | 
  | 
    } | 
| 342 | 
  | 
 | 
| 343 | 
< | 
    // to support 1.ca, let's check the character after the dot | 
| 344 | 
< | 
    // to determine if it is an alpha | 
| 349 | 
< | 
    if (ch == '.' && (ichT + 1 < cchScript) && std::isalpha(script[ichT + 1])) { | 
| 343 | 
> | 
    // to support DMPC.1, let's check the character before the dot | 
| 344 | 
> | 
    if (ch == '.' && (ichT > 0) && std::isalpha(script[ichT - 1])) { | 
| 345 | 
  | 
        return false; | 
| 346 | 
  | 
    } | 
| 347 | 
  | 
 | 
| 384 | 
  | 
        case '(': | 
| 385 | 
  | 
        case ')': | 
| 386 | 
  | 
        case ',': | 
| 392 | 
– | 
        case '*': | 
| 393 | 
– | 
        case '-': | 
| 387 | 
  | 
        case '[': | 
| 388 | 
  | 
        case ']': | 
| 396 | 
– | 
        case '+': | 
| 397 | 
– | 
        case ':': | 
| 398 | 
– | 
        case '@': | 
| 399 | 
– | 
        case '.': | 
| 400 | 
– | 
        case '%': | 
| 389 | 
  | 
        break; | 
| 390 | 
  | 
        case '&': | 
| 391 | 
  | 
        case '|': | 
| 410 | 
  | 
            if ((ch < 'a' || ch > 'z') && (ch < 'A' && ch > 'Z') && ch != '_') { | 
| 411 | 
  | 
                return false; | 
| 412 | 
  | 
            } | 
| 413 | 
+ | 
        case '*': | 
| 414 | 
  | 
        case '?': // include question marks in identifier for atom expressions | 
| 415 | 
< | 
            while (ichT < cchScript && !std::isspace(ch = script[ichT]) && (std::isalpha(ch) ||std::isdigit(ch) || | 
| 416 | 
< | 
                ch == '_' || ch == '?') ) { | 
| 415 | 
> | 
            while (ichT < cchScript && !std::isspace(ch = script[ichT]) &&  | 
| 416 | 
> | 
                    (std::isalpha(ch) ||std::isdigit(ch) || ch == '_' || ch == '.' || ch == '*' || ch == '?' || ch == '+' || ch == '-' || ch == '[' || ch == ']') ){ | 
| 417 | 
  | 
 | 
| 418 | 
  | 
                ++ichT; | 
| 419 | 
  | 
            } | 
| 422 | 
  | 
 | 
| 423 | 
  | 
    cchToken = ichT - ichToken; | 
| 424 | 
  | 
 | 
| 436 | 
– | 
    std::cout << "lookingAtLookupToken: encount " << script.substr(ichToken, cchToken) << std::endl;  | 
| 425 | 
  | 
    return true; | 
| 426 | 
  | 
} | 
| 427 | 
  | 
 | 
| 645 | 
  | 
} | 
| 646 | 
  | 
 | 
| 647 | 
  | 
bool SelectionCompiler::clauseChemObjName() { | 
| 648 | 
< | 
    std::string chemObjName; | 
| 649 | 
< | 
    int tok = tokPeek(); | 
| 662 | 
< | 
    if (!clauseName(chemObjName)){ | 
| 663 | 
< | 
        return false; | 
| 664 | 
< | 
    } | 
| 648 | 
> | 
    Token token = tokenNext(); | 
| 649 | 
> | 
    if (token.tok == Token::identifier && token.value.type() == typeid(std::string)) { | 
| 650 | 
  | 
 | 
| 651 | 
< | 
 | 
| 652 | 
< | 
    tok = tokPeek(); | 
| 653 | 
< | 
    //allow two dot at most | 
| 654 | 
< | 
    if (tok == Token::dot) { | 
| 655 | 
< | 
        tokenNext(); | 
| 656 | 
< | 
        chemObjName += "."; | 
| 657 | 
< | 
        if (!clauseName(chemObjName)) { | 
| 673 | 
< | 
            return false; | 
| 674 | 
< | 
        } | 
| 675 | 
< | 
        tok = tokPeek(); | 
| 676 | 
< | 
        if (tok == Token::dot) { | 
| 677 | 
< | 
            tokenNext(); | 
| 678 | 
< | 
            chemObjName += "."; | 
| 679 | 
< | 
 | 
| 680 | 
< | 
            if (!clauseName(chemObjName)) { | 
| 681 | 
< | 
                return false; | 
| 682 | 
< | 
            } | 
| 683 | 
< | 
        }         | 
| 684 | 
< | 
    } | 
| 651 | 
> | 
        std::string name = boost::any_cast<std::string>(token.value); | 
| 652 | 
> | 
        if (isNameValid(name)) { | 
| 653 | 
> | 
            return addTokenToPostfix(Token(Token::name, name)); | 
| 654 | 
> | 
        } else { | 
| 655 | 
> | 
            return compileError("invalid name: " + name); | 
| 656 | 
> | 
        } | 
| 657 | 
> | 
    }  | 
| 658 | 
  | 
 | 
| 659 | 
< | 
    return addTokenToPostfix(Token(Token::name, chemObjName)); | 
| 659 | 
> | 
    return false; | 
| 660 | 
> | 
         | 
| 661 | 
  | 
} | 
| 662 | 
  | 
 | 
| 663 | 
< | 
bool SelectionCompiler:: clauseName(std::string& name) { | 
| 663 | 
> | 
bool SelectionCompiler::isNameValid(const std::string& name) { | 
| 664 | 
> | 
          int nbracket = 0; | 
| 665 | 
> | 
    int ndot = 0; | 
| 666 | 
> | 
    for (int i =0 ; i < name.size(); ++i) { | 
| 667 | 
> | 
        switch(name[i]) { | 
| 668 | 
  | 
 | 
| 669 | 
< | 
    int tok = tokPeek(); | 
| 670 | 
< | 
 | 
| 671 | 
< | 
    if (tok == Token::asterisk || tok == Token::identifier) { | 
| 672 | 
< | 
        name += boost::any_cast<std::string>(tokenNext().value); | 
| 673 | 
< | 
         | 
| 674 | 
< | 
        while(true){ | 
| 675 | 
< | 
            tok = tokPeek(); | 
| 676 | 
< | 
            switch (tok) { | 
| 677 | 
< | 
                case Token::asterisk : | 
| 700 | 
< | 
                    name += "*"; | 
| 701 | 
< | 
                    tokenNext(); | 
| 702 | 
< | 
                    break; | 
| 703 | 
< | 
                case Token::identifier : | 
| 704 | 
< | 
                    name += boost::any_cast<std::string>(tokenNext().value); | 
| 705 | 
< | 
                    break; | 
| 706 | 
< | 
                case Token::integer : | 
| 707 | 
< | 
                    name += toString(boost::any_cast<int>(tokenNext().value)); | 
| 708 | 
< | 
                    break; | 
| 709 | 
< | 
                case Token::dot : | 
| 710 | 
< | 
                    return true; | 
| 711 | 
< | 
                default : | 
| 712 | 
< | 
                    return true; | 
| 713 | 
< | 
            } | 
| 669 | 
> | 
          case '[' : | 
| 670 | 
> | 
              ++nbracket; | 
| 671 | 
> | 
              break; | 
| 672 | 
> | 
          case ']' : | 
| 673 | 
> | 
              --nbracket; | 
| 674 | 
> | 
              break; | 
| 675 | 
> | 
          case '.' : | 
| 676 | 
> | 
              ++ndot; | 
| 677 | 
> | 
              break;        | 
| 678 | 
  | 
        } | 
| 715 | 
– | 
         | 
| 716 | 
– | 
    }else { | 
| 717 | 
– | 
        return false; | 
| 679 | 
  | 
    } | 
| 680 | 
  | 
 | 
| 681 | 
+ | 
    //only allow 3 dots at most | 
| 682 | 
+ | 
    return (ndot <=3 && nbracket == 0) ? true : false; | 
| 683 | 
  | 
} | 
| 684 | 
  | 
 | 
| 685 | 
  | 
bool SelectionCompiler::clauseIndex(){ |