ViewVC Help
View File | Revision Log | Show Annotations | View Changeset | Root Listing
root/OpenMD/trunk/src/mdParser/MDTreeParser.cpp
(Generate patch)

Comparing trunk/src/mdParser/MDTreeParser.cpp (file contents):
Revision 770 by tim, Fri Dec 2 15:38:03 2005 UTC vs.
Revision 814 by tim, Fri Dec 16 02:57:00 2005 UTC

# Line 117 | Line 117 | void MDTreeParser::componentblock(ANTLR_USE_NAMESPACE(
117          ANTLR_USE_NAMESPACE(antlr)RefAST componentblock_AST_in = (_t == ASTNULL) ? ANTLR_USE_NAMESPACE(antlr)nullAST : _t;
118          
119          try {      // for error handling
120 <                ANTLR_USE_NAMESPACE(antlr)RefAST __t13 = _t;
120 >                ANTLR_USE_NAMESPACE(antlr)RefAST __t9 = _t;
121                  ANTLR_USE_NAMESPACE(antlr)RefAST tmp2_AST_in = _t;
122                  match(_t,COMPONENT);
123                  _t = _t->getFirstChild();
124 < #line 69 "MDTreeParser.g"
124 > #line 62 "MDTreeParser.g"
125                  Component* currComponet = new Component(); blockStack.push(currComponet);
126   #line 127 "MDTreeParser.cpp"
127                  { // ( ... )*
# Line 133 | Line 133 | void MDTreeParser::componentblock(ANTLR_USE_NAMESPACE(
133                                  _t = _retTree;
134                          }
135                          else {
136 <                                goto _loop15;
136 >                                goto _loop11;
137                          }
138                          
139                  }
140 <                _loop15:;
140 >                _loop11:;
141                  } // ( ... )*
142                  ANTLR_USE_NAMESPACE(antlr)RefAST tmp3_AST_in = _t;
143                  match(_t,ENDBLOCK);
144                  _t = _t->getNextSibling();
145 <                _t = __t13;
145 >                _t = __t9;
146                  _t = _t->getNextSibling();
147 < #line 71 "MDTreeParser.g"
147 > #line 64 "MDTreeParser.g"
148                  blockStack.top()->validate();blockStack.pop(); currConf->addComponent(currComponet);
149   #line 150 "MDTreeParser.cpp"
150          }
# Line 160 | Line 160 | void MDTreeParser::moleculeblock(ANTLR_USE_NAMESPACE(a
160          ANTLR_USE_NAMESPACE(antlr)RefAST moleculeblock_AST_in = (_t == ASTNULL) ? ANTLR_USE_NAMESPACE(antlr)nullAST : _t;
161          
162          try {      // for error handling
163 <                ANTLR_USE_NAMESPACE(antlr)RefAST __t21 = _t;
163 >                ANTLR_USE_NAMESPACE(antlr)RefAST __t17 = _t;
164                  ANTLR_USE_NAMESPACE(antlr)RefAST tmp4_AST_in = _t;
165                  match(_t,MOLECULE);
166                  _t = _t->getFirstChild();
167 < #line 79 "MDTreeParser.g"
167 > #line 72 "MDTreeParser.g"
168                  MoleculeStamp* currMoleculeStamp = new MoleculeStamp(); blockStack.push(currMoleculeStamp);
169   #line 170 "MDTreeParser.cpp"
170                  { // ( ... )*
# Line 176 | Line 176 | void MDTreeParser::moleculeblock(ANTLR_USE_NAMESPACE(a
176                                  _t = _retTree;
177                          }
178                          else {
179 <                                goto _loop23;
179 >                                goto _loop19;
180                          }
181                          
182                  }
183 <                _loop23:;
183 >                _loop19:;
184                  } // ( ... )*
185                  ANTLR_USE_NAMESPACE(antlr)RefAST tmp5_AST_in = _t;
186                  match(_t,ENDBLOCK);
187                  _t = _t->getNextSibling();
188 <                _t = __t21;
188 >                _t = __t17;
189                  _t = _t->getNextSibling();
190 < #line 81 "MDTreeParser.g"
190 > #line 74 "MDTreeParser.g"
191                  blockStack.top()->validate(); blockStack.pop(); currConf->addMoleculeStamp(currMoleculeStamp);
192   #line 193 "MDTreeParser.cpp"
193          }
# Line 203 | Line 203 | void MDTreeParser::zconstraintblock(ANTLR_USE_NAMESPAC
203          ANTLR_USE_NAMESPACE(antlr)RefAST zconstraintblock_AST_in = (_t == ASTNULL) ? ANTLR_USE_NAMESPACE(antlr)nullAST : _t;
204          
205          try {      // for error handling
206 <                ANTLR_USE_NAMESPACE(antlr)RefAST __t17 = _t;
206 >                ANTLR_USE_NAMESPACE(antlr)RefAST __t13 = _t;
207                  ANTLR_USE_NAMESPACE(antlr)RefAST tmp6_AST_in = _t;
208                  match(_t,ZCONSTRAINT);
209                  _t = _t->getFirstChild();
210 < #line 74 "MDTreeParser.g"
210 > #line 67 "MDTreeParser.g"
211                  ZConsStamp* currZConsStamp = new ZConsStamp(); blockStack.push(currZConsStamp);
212   #line 213 "MDTreeParser.cpp"
213                  { // ( ... )*
# Line 219 | Line 219 | void MDTreeParser::zconstraintblock(ANTLR_USE_NAMESPAC
219                                  _t = _retTree;
220                          }
221                          else {
222 <                                goto _loop19;
222 >                                goto _loop15;
223                          }
224                          
225                  }
226 <                _loop19:;
226 >                _loop15:;
227                  } // ( ... )*
228                  ANTLR_USE_NAMESPACE(antlr)RefAST tmp7_AST_in = _t;
229                  match(_t,ENDBLOCK);
230                  _t = _t->getNextSibling();
231 <                _t = __t17;
231 >                _t = __t13;
232                  _t = _t->getNextSibling();
233 < #line 76 "MDTreeParser.g"
233 > #line 69 "MDTreeParser.g"
234                  blockStack.top()->validate();blockStack.pop(); currConf->addZConsStamp(currZConsStamp);
235   #line 236 "MDTreeParser.cpp"
236          }
# Line 248 | Line 248 | void MDTreeParser::constant(ANTLR_USE_NAMESPACE(antlr)
248          ANTLR_USE_NAMESPACE(antlr)RefAST constant_AST_in = (_t == ASTNULL) ? ANTLR_USE_NAMESPACE(antlr)nullAST : _t;
249          ANTLR_USE_NAMESPACE(antlr)RefAST str1 = ANTLR_USE_NAMESPACE(antlr)nullAST;
250          ANTLR_USE_NAMESPACE(antlr)RefAST str2 = ANTLR_USE_NAMESPACE(antlr)nullAST;
251 + #line 47 "MDTreeParser.g"
252          
253 +        int ival;
254 +        double dval;
255 +        
256 + #line 257 "MDTreeParser.cpp"
257 +        
258          try {      // for error handling
259                  if (_t == ANTLR_USE_NAMESPACE(antlr)nullAST )
260                          _t = ASTNULL;
261                  switch ( _t->getType()) {
262 <                case OCTALINT:
263 <                case DECIMALINT:
258 <                case HEXADECIMALINT:
259 <                case MINUS:
260 <                case FLOATONE:
261 <                case FLOATTWO:
262 >                case NUM_INT:
263 >                case NUM_LONG:
264                  {
265 <                        signedIntOrFloat(_t,id);
265 >                        ival=intConst(_t);
266 >                        _t = _retTree;
267 > #line 52 "MDTreeParser.g"
268 >                        blockStack.top()->assign(id->getText(), ival);
269 > #line 270 "MDTreeParser.cpp"
270 >                        break;
271 >                }
272 >                case NUM_FLOAT:
273 >                case NUM_DOUBLE:
274 >                {
275 >                        dval=floatConst(_t);
276                          _t = _retTree;
277 + #line 53 "MDTreeParser.g"
278 +                        blockStack.top()->assign(id->getText(), dval);
279 + #line 280 "MDTreeParser.cpp"
280                          break;
281                  }
282                  case ID:
# Line 269 | Line 284 | void MDTreeParser::constant(ANTLR_USE_NAMESPACE(antlr)
284                          str1 = _t;
285                          match(_t,ID);
286                          _t = _t->getNextSibling();
287 < #line 49 "MDTreeParser.g"
287 > #line 54 "MDTreeParser.g"
288                          blockStack.top()->assign(id->getText(), str1->getText());
289 < #line 275 "MDTreeParser.cpp"
289 > #line 290 "MDTreeParser.cpp"
290                          break;
291                  }
292                  case StringLiteral:
# Line 279 | Line 294 | void MDTreeParser::constant(ANTLR_USE_NAMESPACE(antlr)
294                          str2 = _t;
295                          match(_t,StringLiteral);
296                          _t = _t->getNextSibling();
297 < #line 50 "MDTreeParser.g"
297 > #line 55 "MDTreeParser.g"
298                          std::string s =  str2->getText();
299                          s = s.substr(1, s.length()-2);
300                          blockStack.top()->assign(id->getText(),s);
301                          
302 < #line 288 "MDTreeParser.cpp"
302 > #line 303 "MDTreeParser.cpp"
303                          break;
304                  }
305                  default:
# Line 301 | Line 316 | void MDTreeParser::constant(ANTLR_USE_NAMESPACE(antlr)
316          _retTree = _t;
317   }
318  
319 < void MDTreeParser::signedIntOrFloat(ANTLR_USE_NAMESPACE(antlr)RefAST _t,
320 <        ANTLR_USE_NAMESPACE(antlr)RefAST id
306 < ) {
307 <        ANTLR_USE_NAMESPACE(antlr)RefAST signedIntOrFloat_AST_in = (_t == ASTNULL) ? ANTLR_USE_NAMESPACE(antlr)nullAST : _t;
308 <        ANTLR_USE_NAMESPACE(antlr)RefAST icMinus = ANTLR_USE_NAMESPACE(antlr)nullAST;
309 <        ANTLR_USE_NAMESPACE(antlr)RefAST fcMinus = ANTLR_USE_NAMESPACE(antlr)nullAST;
310 <        ANTLR_USE_NAMESPACE(antlr)RefAST ic = ANTLR_USE_NAMESPACE(antlr)nullAST;
311 <        ANTLR_USE_NAMESPACE(antlr)RefAST fc = ANTLR_USE_NAMESPACE(antlr)nullAST;
312 < #line 56 "MDTreeParser.g"
313 <        
319 > int  MDTreeParser::intConst(ANTLR_USE_NAMESPACE(antlr)RefAST _t) {
320 > #line 242 "MDTreeParser.g"
321          int ival;
322 <        double dval;
322 > #line 323 "MDTreeParser.cpp"
323 >        ANTLR_USE_NAMESPACE(antlr)RefAST intConst_AST_in = (_t == ASTNULL) ? ANTLR_USE_NAMESPACE(antlr)nullAST : _t;
324 >        ANTLR_USE_NAMESPACE(antlr)RefAST i1 = ANTLR_USE_NAMESPACE(antlr)nullAST;
325 >        ANTLR_USE_NAMESPACE(antlr)RefAST i2 = ANTLR_USE_NAMESPACE(antlr)nullAST;
326          
317 – #line 318 "MDTreeParser.cpp"
318 –        
327          try {      // for error handling
328                  if (_t == ANTLR_USE_NAMESPACE(antlr)nullAST )
329                          _t = ASTNULL;
330                  switch ( _t->getType()) {
331 <                case MINUS:
331 >                case NUM_INT:
332                  {
333 <                        ANTLR_USE_NAMESPACE(antlr)RefAST __t9 = _t;
334 <                        ANTLR_USE_NAMESPACE(antlr)RefAST tmp8_AST_in = _t;
327 <                        match(_t,MINUS);
328 <                        _t = _t->getFirstChild();
329 <                        {
330 <                        if (_t == ANTLR_USE_NAMESPACE(antlr)nullAST )
331 <                                _t = ASTNULL;
332 <                        switch ( _t->getType()) {
333 <                        case OCTALINT:
334 <                        case DECIMALINT:
335 <                        case HEXADECIMALINT:
336 <                        {
337 <                                icMinus = (_t == ASTNULL) ? ANTLR_USE_NAMESPACE(antlr)nullAST : _t;
338 <                                intConst(_t);
339 <                                _t = _retTree;
340 < #line 61 "MDTreeParser.g"
341 <                                ival = lexi_cast<int>(icMinus->getText()); ival = -ival; blockStack.top()->assign(id->getText(), ival);
342 < #line 343 "MDTreeParser.cpp"
343 <                                break;
344 <                        }
345 <                        case FLOATONE:
346 <                        case FLOATTWO:
347 <                        {
348 <                                fcMinus = (_t == ASTNULL) ? ANTLR_USE_NAMESPACE(antlr)nullAST : _t;
349 <                                floatConst(_t);
350 <                                _t = _retTree;
351 <                                break;
352 <                        }
353 <                        default:
354 <                        {
355 <                                throw ANTLR_USE_NAMESPACE(antlr)NoViableAltException(_t);
356 <                        }
357 <                        }
358 <                        }
359 < #line 62 "MDTreeParser.g"
360 <                        dval = lexi_cast<double>(fcMinus->getText());dval = -dval;  blockStack.top()->assign(id->getText(), dval);
361 < #line 362 "MDTreeParser.cpp"
362 <                        _t = __t9;
333 >                        i1 = _t;
334 >                        match(_t,NUM_INT);
335                          _t = _t->getNextSibling();
336 + #line 243 "MDTreeParser.g"
337 +                        ival = lexi_cast<int>(i1->getText());
338 + #line 339 "MDTreeParser.cpp"
339                          break;
340                  }
341 <                case OCTALINT:
367 <                case DECIMALINT:
368 <                case HEXADECIMALINT:
369 <                case FLOATONE:
370 <                case FLOATTWO:
371 <                {
372 <                        {
373 <                        if (_t == ANTLR_USE_NAMESPACE(antlr)nullAST )
374 <                                _t = ASTNULL;
375 <                        switch ( _t->getType()) {
376 <                        case OCTALINT:
377 <                        case DECIMALINT:
378 <                        case HEXADECIMALINT:
379 <                        {
380 <                                ic = (_t == ASTNULL) ? ANTLR_USE_NAMESPACE(antlr)nullAST : _t;
381 <                                intConst(_t);
382 <                                _t = _retTree;
383 < #line 64 "MDTreeParser.g"
384 <                                ival = lexi_cast<int>(ic->getText()); blockStack.top()->assign(id->getText(), ival);
385 < #line 386 "MDTreeParser.cpp"
386 <                                break;
387 <                        }
388 <                        case FLOATONE:
389 <                        case FLOATTWO:
390 <                        {
391 <                                fc = (_t == ASTNULL) ? ANTLR_USE_NAMESPACE(antlr)nullAST : _t;
392 <                                floatConst(_t);
393 <                                _t = _retTree;
394 < #line 65 "MDTreeParser.g"
395 <                                dval = lexi_cast<double>(fc->getText());  blockStack.top()->assign(id->getText(), dval);
396 < #line 397 "MDTreeParser.cpp"
397 <                                break;
398 <                        }
399 <                        default:
400 <                        {
401 <                                throw ANTLR_USE_NAMESPACE(antlr)NoViableAltException(_t);
402 <                        }
403 <                        }
404 <                        }
405 <                        break;
406 <                }
407 <                default:
408 <                {
409 <                        throw ANTLR_USE_NAMESPACE(antlr)NoViableAltException(_t);
410 <                }
411 <                }
412 <        }
413 <        catch (ANTLR_USE_NAMESPACE(antlr)RecognitionException& ex) {
414 <                reportError(ex);
415 <                if ( _t != ANTLR_USE_NAMESPACE(antlr)nullAST )
416 <                        _t = _t->getNextSibling();
417 <        }
418 <        _retTree = _t;
419 < }
420 <
421 < int  MDTreeParser::intConst(ANTLR_USE_NAMESPACE(antlr)RefAST _t) {
422 < #line 249 "MDTreeParser.g"
423 <        int ival;
424 < #line 425 "MDTreeParser.cpp"
425 <        ANTLR_USE_NAMESPACE(antlr)RefAST intConst_AST_in = (_t == ASTNULL) ? ANTLR_USE_NAMESPACE(antlr)nullAST : _t;
426 <        ANTLR_USE_NAMESPACE(antlr)RefAST oival = ANTLR_USE_NAMESPACE(antlr)nullAST;
427 <        ANTLR_USE_NAMESPACE(antlr)RefAST dival = ANTLR_USE_NAMESPACE(antlr)nullAST;
428 <        ANTLR_USE_NAMESPACE(antlr)RefAST hival = ANTLR_USE_NAMESPACE(antlr)nullAST;
429 <        
430 <        try {      // for error handling
431 <                if (_t == ANTLR_USE_NAMESPACE(antlr)nullAST )
432 <                        _t = ASTNULL;
433 <                switch ( _t->getType()) {
434 <                case OCTALINT:
435 <                {
436 <                        oival = _t;
437 <                        match(_t,OCTALINT);
438 <                        _t = _t->getNextSibling();
439 < #line 250 "MDTreeParser.g"
440 <                        ival = lexi_cast<int>(oival->getText());
441 < #line 442 "MDTreeParser.cpp"
442 <                        break;
443 <                }
444 <                case DECIMALINT:
341 >                case NUM_LONG:
342                  {
343 <                        dival = _t;
344 <                        match(_t,DECIMALINT);
343 >                        i2 = _t;
344 >                        match(_t,NUM_LONG);
345                          _t = _t->getNextSibling();
346 < #line 251 "MDTreeParser.g"
347 <                        ival = lexi_cast<int>(dival->getText());
348 < #line 452 "MDTreeParser.cpp"
346 > #line 244 "MDTreeParser.g"
347 >                        ival = lexi_cast<int>(i2->getText());
348 > #line 349 "MDTreeParser.cpp"
349                          break;
350                  }
454 –                case HEXADECIMALINT:
455 –                {
456 –                        hival = _t;
457 –                        match(_t,HEXADECIMALINT);
458 –                        _t = _t->getNextSibling();
459 – #line 252 "MDTreeParser.g"
460 –                        ival = lexi_cast<int>(hival->getText());
461 – #line 462 "MDTreeParser.cpp"
462 –                        break;
463 –                }
351                  default:
352                  {
353                          throw ANTLR_USE_NAMESPACE(antlr)NoViableAltException(_t);
# Line 477 | Line 364 | double  MDTreeParser::floatConst(ANTLR_USE_NAMESPACE(a
364   }
365  
366   double  MDTreeParser::floatConst(ANTLR_USE_NAMESPACE(antlr)RefAST _t) {
367 < #line 266 "MDTreeParser.g"
367 > #line 256 "MDTreeParser.g"
368          double dval;
369 < #line 483 "MDTreeParser.cpp"
369 > #line 370 "MDTreeParser.cpp"
370          ANTLR_USE_NAMESPACE(antlr)RefAST floatConst_AST_in = (_t == ASTNULL) ? ANTLR_USE_NAMESPACE(antlr)nullAST : _t;
371          ANTLR_USE_NAMESPACE(antlr)RefAST d1 = ANTLR_USE_NAMESPACE(antlr)nullAST;
372          ANTLR_USE_NAMESPACE(antlr)RefAST d2 = ANTLR_USE_NAMESPACE(antlr)nullAST;
# Line 488 | Line 375 | double  MDTreeParser::floatConst(ANTLR_USE_NAMESPACE(a
375                  if (_t == ANTLR_USE_NAMESPACE(antlr)nullAST )
376                          _t = ASTNULL;
377                  switch ( _t->getType()) {
378 <                case FLOATONE:
378 >                case NUM_FLOAT:
379                  {
380                          d1 = _t;
381 <                        match(_t,FLOATONE);
381 >                        match(_t,NUM_FLOAT);
382                          _t = _t->getNextSibling();
383 < #line 267 "MDTreeParser.g"
383 > #line 257 "MDTreeParser.g"
384                          dval = lexi_cast<double>(d1->getText());
385 < #line 499 "MDTreeParser.cpp"
385 > #line 386 "MDTreeParser.cpp"
386                          break;
387                  }
388 <                case FLOATTWO:
388 >                case NUM_DOUBLE:
389                  {
390                          d2 = _t;
391 <                        match(_t,FLOATTWO);
391 >                        match(_t,NUM_DOUBLE);
392                          _t = _t->getNextSibling();
393 < #line 268 "MDTreeParser.g"
393 > #line 258 "MDTreeParser.g"
394                          dval = lexi_cast<double>(d2->getText());
395 < #line 509 "MDTreeParser.cpp"
395 > #line 396 "MDTreeParser.cpp"
396                          break;
397                  }
398                  default:
# Line 594 | Line 481 | void MDTreeParser::atomblock(ANTLR_USE_NAMESPACE(antlr
481  
482   void MDTreeParser::atomblock(ANTLR_USE_NAMESPACE(antlr)RefAST _t) {
483          ANTLR_USE_NAMESPACE(antlr)RefAST atomblock_AST_in = (_t == ASTNULL) ? ANTLR_USE_NAMESPACE(antlr)nullAST : _t;
484 < #line 94 "MDTreeParser.g"
484 > #line 87 "MDTreeParser.g"
485          
486          int index;
487          
488 < #line 602 "MDTreeParser.cpp"
488 > #line 489 "MDTreeParser.cpp"
489          
490          try {      // for error handling
491 <                ANTLR_USE_NAMESPACE(antlr)RefAST __t26 = _t;
492 <                ANTLR_USE_NAMESPACE(antlr)RefAST tmp9_AST_in = _t;
491 >                ANTLR_USE_NAMESPACE(antlr)RefAST __t22 = _t;
492 >                ANTLR_USE_NAMESPACE(antlr)RefAST tmp8_AST_in = _t;
493                  match(_t,ATOM);
494                  _t = _t->getFirstChild();
495                  index=intConst(_t);
496                  _t = _retTree;
497 < #line 98 "MDTreeParser.g"
497 > #line 91 "MDTreeParser.g"
498                  AtomStamp* currAtomStamp = new AtomStamp(index); blockStack.push(currAtomStamp);
499 < #line 613 "MDTreeParser.cpp"
499 > #line 500 "MDTreeParser.cpp"
500                  { // ( ... )*
501                  for (;;) {
502                          if (_t == ANTLR_USE_NAMESPACE(antlr)nullAST )
# Line 619 | Line 506 | void MDTreeParser::atomblock(ANTLR_USE_NAMESPACE(antlr
506                                  _t = _retTree;
507                          }
508                          else {
509 <                                goto _loop28;
509 >                                goto _loop24;
510                          }
511                          
512                  }
513 <                _loop28:;
513 >                _loop24:;
514                  } // ( ... )*
515 <                ANTLR_USE_NAMESPACE(antlr)RefAST tmp10_AST_in = _t;
515 >                ANTLR_USE_NAMESPACE(antlr)RefAST tmp9_AST_in = _t;
516                  match(_t,ENDBLOCK);
517                  _t = _t->getNextSibling();
518 <                _t = __t26;
518 >                _t = __t22;
519                  _t = _t->getNextSibling();
520 < #line 100 "MDTreeParser.g"
520 > #line 93 "MDTreeParser.g"
521                  
522                  blockStack.top()->validate();
523                  blockStack.pop();
524                  MoleculeStamp* currMoleculeStamp = static_cast<MoleculeStamp*>(blockStack.top());
525                  currMoleculeStamp->addAtomStamp(currAtomStamp);
526                  
527 < #line 641 "MDTreeParser.cpp"
527 > #line 528 "MDTreeParser.cpp"
528          }
529          catch (ANTLR_USE_NAMESPACE(antlr)RecognitionException& ex) {
530                  reportError(ex);
# Line 651 | Line 538 | void MDTreeParser::bondblock(ANTLR_USE_NAMESPACE(antlr
538          ANTLR_USE_NAMESPACE(antlr)RefAST bondblock_AST_in = (_t == ASTNULL) ? ANTLR_USE_NAMESPACE(antlr)nullAST : _t;
539          
540          try {      // for error handling
541 <                ANTLR_USE_NAMESPACE(antlr)RefAST __t33 = _t;
542 <                ANTLR_USE_NAMESPACE(antlr)RefAST tmp11_AST_in = _t;
541 >                ANTLR_USE_NAMESPACE(antlr)RefAST __t29 = _t;
542 >                ANTLR_USE_NAMESPACE(antlr)RefAST tmp10_AST_in = _t;
543                  match(_t,BOND);
544                  _t = _t->getFirstChild();
545 < #line 120 "MDTreeParser.g"
545 > #line 113 "MDTreeParser.g"
546                  BondStamp* currBondStamp = new BondStamp(); blockStack.push(currBondStamp);
547 < #line 661 "MDTreeParser.cpp"
547 > #line 548 "MDTreeParser.cpp"
548                  { // ( ... )*
549                  for (;;) {
550                          if (_t == ANTLR_USE_NAMESPACE(antlr)nullAST )
# Line 667 | Line 554 | void MDTreeParser::bondblock(ANTLR_USE_NAMESPACE(antlr
554                                  _t = _retTree;
555                          }
556                          else {
557 <                                goto _loop35;
557 >                                goto _loop31;
558                          }
559                          
560                  }
561 <                _loop35:;
561 >                _loop31:;
562                  } // ( ... )*
563 <                ANTLR_USE_NAMESPACE(antlr)RefAST tmp12_AST_in = _t;
563 >                ANTLR_USE_NAMESPACE(antlr)RefAST tmp11_AST_in = _t;
564                  match(_t,ENDBLOCK);
565                  _t = _t->getNextSibling();
566 <                _t = __t33;
566 >                _t = __t29;
567                  _t = _t->getNextSibling();
568 < #line 122 "MDTreeParser.g"
568 > #line 115 "MDTreeParser.g"
569                  
570                  blockStack.pop();
571                  MoleculeStamp* currMoleculeStamp = static_cast<MoleculeStamp*>(blockStack.top());
572                  currMoleculeStamp->addBondStamp(currBondStamp);
573                  
574 < #line 688 "MDTreeParser.cpp"
574 > #line 575 "MDTreeParser.cpp"
575          }
576          catch (ANTLR_USE_NAMESPACE(antlr)RecognitionException& ex) {
577                  reportError(ex);
# Line 698 | Line 585 | void MDTreeParser::bendblock(ANTLR_USE_NAMESPACE(antlr
585          ANTLR_USE_NAMESPACE(antlr)RefAST bendblock_AST_in = (_t == ASTNULL) ? ANTLR_USE_NAMESPACE(antlr)nullAST : _t;
586          
587          try {      // for error handling
588 <                ANTLR_USE_NAMESPACE(antlr)RefAST __t39 = _t;
589 <                ANTLR_USE_NAMESPACE(antlr)RefAST tmp13_AST_in = _t;
588 >                ANTLR_USE_NAMESPACE(antlr)RefAST __t35 = _t;
589 >                ANTLR_USE_NAMESPACE(antlr)RefAST tmp12_AST_in = _t;
590                  match(_t,BEND);
591                  _t = _t->getFirstChild();
592 < #line 138 "MDTreeParser.g"
592 > #line 131 "MDTreeParser.g"
593                  BendStamp* currBendStamp = new BendStamp(); blockStack.push(currBendStamp);
594 < #line 708 "MDTreeParser.cpp"
594 > #line 595 "MDTreeParser.cpp"
595                  { // ( ... )*
596                  for (;;) {
597                          if (_t == ANTLR_USE_NAMESPACE(antlr)nullAST )
# Line 714 | Line 601 | void MDTreeParser::bendblock(ANTLR_USE_NAMESPACE(antlr
601                                  _t = _retTree;
602                          }
603                          else {
604 <                                goto _loop41;
604 >                                goto _loop37;
605                          }
606                          
607                  }
608 <                _loop41:;
608 >                _loop37:;
609                  } // ( ... )*
610 <                ANTLR_USE_NAMESPACE(antlr)RefAST tmp14_AST_in = _t;
610 >                ANTLR_USE_NAMESPACE(antlr)RefAST tmp13_AST_in = _t;
611                  match(_t,ENDBLOCK);
612                  _t = _t->getNextSibling();
613 <                _t = __t39;
613 >                _t = __t35;
614                  _t = _t->getNextSibling();
615 < #line 140 "MDTreeParser.g"
615 > #line 133 "MDTreeParser.g"
616                  
617                  blockStack.top()->validate();
618                  blockStack.pop();
619                  MoleculeStamp* currMoleculeStamp = static_cast<MoleculeStamp*>(blockStack.top());
620                  currMoleculeStamp->addBendStamp(currBendStamp);
621                  
622 < #line 736 "MDTreeParser.cpp"
622 > #line 623 "MDTreeParser.cpp"
623          }
624          catch (ANTLR_USE_NAMESPACE(antlr)RecognitionException& ex) {
625                  reportError(ex);
# Line 746 | Line 633 | void MDTreeParser::torsionblock(ANTLR_USE_NAMESPACE(an
633          ANTLR_USE_NAMESPACE(antlr)RefAST torsionblock_AST_in = (_t == ASTNULL) ? ANTLR_USE_NAMESPACE(antlr)nullAST : _t;
634          
635          try {      // for error handling
636 <                ANTLR_USE_NAMESPACE(antlr)RefAST __t45 = _t;
637 <                ANTLR_USE_NAMESPACE(antlr)RefAST tmp15_AST_in = _t;
636 >                ANTLR_USE_NAMESPACE(antlr)RefAST __t41 = _t;
637 >                ANTLR_USE_NAMESPACE(antlr)RefAST tmp14_AST_in = _t;
638                  match(_t,TORSION);
639                  _t = _t->getFirstChild();
640 < #line 157 "MDTreeParser.g"
640 > #line 150 "MDTreeParser.g"
641                  TorsionStamp* currTorsionStamp = new TorsionStamp(); blockStack.push(currTorsionStamp);
642 < #line 756 "MDTreeParser.cpp"
642 > #line 643 "MDTreeParser.cpp"
643                  { // ( ... )*
644                  for (;;) {
645                          if (_t == ANTLR_USE_NAMESPACE(antlr)nullAST )
# Line 762 | Line 649 | void MDTreeParser::torsionblock(ANTLR_USE_NAMESPACE(an
649                                  _t = _retTree;
650                          }
651                          else {
652 <                                goto _loop47;
652 >                                goto _loop43;
653                          }
654                          
655                  }
656 <                _loop47:;
656 >                _loop43:;
657                  } // ( ... )*
658 <                ANTLR_USE_NAMESPACE(antlr)RefAST tmp16_AST_in = _t;
658 >                ANTLR_USE_NAMESPACE(antlr)RefAST tmp15_AST_in = _t;
659                  match(_t,ENDBLOCK);
660                  _t = _t->getNextSibling();
661 <                _t = __t45;
661 >                _t = __t41;
662                  _t = _t->getNextSibling();
663 < #line 159 "MDTreeParser.g"
663 > #line 152 "MDTreeParser.g"
664                  
665                  blockStack.top()->validate();
666                  blockStack.pop();
667                  MoleculeStamp* currMoleculeStamp = static_cast<MoleculeStamp*>(blockStack.top());
668                  currMoleculeStamp->addTorsionStamp(currTorsionStamp);
669                  
670 < #line 784 "MDTreeParser.cpp"
670 > #line 671 "MDTreeParser.cpp"
671          }
672          catch (ANTLR_USE_NAMESPACE(antlr)RecognitionException& ex) {
673                  reportError(ex);
# Line 792 | Line 679 | void MDTreeParser::rigidbodyblock(ANTLR_USE_NAMESPACE(
679  
680   void MDTreeParser::rigidbodyblock(ANTLR_USE_NAMESPACE(antlr)RefAST _t) {
681          ANTLR_USE_NAMESPACE(antlr)RefAST rigidbodyblock_AST_in = (_t == ASTNULL) ? ANTLR_USE_NAMESPACE(antlr)nullAST : _t;
682 < #line 176 "MDTreeParser.g"
682 > #line 169 "MDTreeParser.g"
683          
684          int index;
685          
686 < #line 800 "MDTreeParser.cpp"
686 > #line 687 "MDTreeParser.cpp"
687          
688          try {      // for error handling
689 <                ANTLR_USE_NAMESPACE(antlr)RefAST __t51 = _t;
690 <                ANTLR_USE_NAMESPACE(antlr)RefAST tmp17_AST_in = _t;
689 >                ANTLR_USE_NAMESPACE(antlr)RefAST __t47 = _t;
690 >                ANTLR_USE_NAMESPACE(antlr)RefAST tmp16_AST_in = _t;
691                  match(_t,RIGIDBODY);
692                  _t = _t->getFirstChild();
693                  index=intConst(_t);
694                  _t = _retTree;
695 < #line 180 "MDTreeParser.g"
695 > #line 173 "MDTreeParser.g"
696                  RigidBodyStamp* currRigidBodyStamp = new RigidBodyStamp(index); blockStack.push(currRigidBodyStamp);
697 < #line 811 "MDTreeParser.cpp"
697 > #line 698 "MDTreeParser.cpp"
698                  { // ( ... )*
699                  for (;;) {
700                          if (_t == ANTLR_USE_NAMESPACE(antlr)nullAST )
# Line 817 | Line 704 | void MDTreeParser::rigidbodyblock(ANTLR_USE_NAMESPACE(
704                                  _t = _retTree;
705                          }
706                          else {
707 <                                goto _loop53;
707 >                                goto _loop49;
708                          }
709                          
710                  }
711 <                _loop53:;
711 >                _loop49:;
712                  } // ( ... )*
713 <                ANTLR_USE_NAMESPACE(antlr)RefAST tmp18_AST_in = _t;
713 >                ANTLR_USE_NAMESPACE(antlr)RefAST tmp17_AST_in = _t;
714                  match(_t,ENDBLOCK);
715                  _t = _t->getNextSibling();
716 <                _t = __t51;
716 >                _t = __t47;
717                  _t = _t->getNextSibling();
718 < #line 182 "MDTreeParser.g"
718 > #line 175 "MDTreeParser.g"
719                  
720                  blockStack.top()->validate();
721                  blockStack.pop();
722                  MoleculeStamp* currMoleculeStamp = static_cast<MoleculeStamp*>(blockStack.top());
723                  currMoleculeStamp->addRigidBodyStamp(currRigidBodyStamp);
724                  
725 < #line 839 "MDTreeParser.cpp"
725 > #line 726 "MDTreeParser.cpp"
726          }
727          catch (ANTLR_USE_NAMESPACE(antlr)RecognitionException& ex) {
728                  reportError(ex);
# Line 849 | Line 736 | void MDTreeParser::cutoffgroupblock(ANTLR_USE_NAMESPAC
736          ANTLR_USE_NAMESPACE(antlr)RefAST cutoffgroupblock_AST_in = (_t == ASTNULL) ? ANTLR_USE_NAMESPACE(antlr)nullAST : _t;
737          
738          try {      // for error handling
739 <                ANTLR_USE_NAMESPACE(antlr)RefAST __t57 = _t;
740 <                ANTLR_USE_NAMESPACE(antlr)RefAST tmp19_AST_in = _t;
739 >                ANTLR_USE_NAMESPACE(antlr)RefAST __t53 = _t;
740 >                ANTLR_USE_NAMESPACE(antlr)RefAST tmp18_AST_in = _t;
741                  match(_t,CUTOFFGROUP);
742                  _t = _t->getFirstChild();
743 < #line 199 "MDTreeParser.g"
743 > #line 192 "MDTreeParser.g"
744                  CutoffGroupStamp* currCutoffGroupStamp = new CutoffGroupStamp(); blockStack.push(currCutoffGroupStamp);
745 < #line 859 "MDTreeParser.cpp"
745 > #line 746 "MDTreeParser.cpp"
746                  { // ( ... )*
747                  for (;;) {
748                          if (_t == ANTLR_USE_NAMESPACE(antlr)nullAST )
# Line 865 | Line 752 | void MDTreeParser::cutoffgroupblock(ANTLR_USE_NAMESPAC
752                                  _t = _retTree;
753                          }
754                          else {
755 <                                goto _loop59;
755 >                                goto _loop55;
756                          }
757                          
758                  }
759 <                _loop59:;
759 >                _loop55:;
760                  } // ( ... )*
761 <                ANTLR_USE_NAMESPACE(antlr)RefAST tmp20_AST_in = _t;
761 >                ANTLR_USE_NAMESPACE(antlr)RefAST tmp19_AST_in = _t;
762                  match(_t,ENDBLOCK);
763                  _t = _t->getNextSibling();
764 <                _t = __t57;
764 >                _t = __t53;
765                  _t = _t->getNextSibling();
766 < #line 201 "MDTreeParser.g"
766 > #line 194 "MDTreeParser.g"
767                  
768                  blockStack.top()->validate();
769                  blockStack.pop();
770                  MoleculeStamp* currMoleculeStamp = static_cast<MoleculeStamp*>(blockStack.top());
771                  currMoleculeStamp->addCutoffGroupStamp(currCutoffGroupStamp);
772                  
773 < #line 887 "MDTreeParser.cpp"
773 > #line 774 "MDTreeParser.cpp"
774          }
775          catch (ANTLR_USE_NAMESPACE(antlr)RecognitionException& ex) {
776                  reportError(ex);
# Line 895 | Line 782 | void MDTreeParser::fragmentblock(ANTLR_USE_NAMESPACE(a
782  
783   void MDTreeParser::fragmentblock(ANTLR_USE_NAMESPACE(antlr)RefAST _t) {
784          ANTLR_USE_NAMESPACE(antlr)RefAST fragmentblock_AST_in = (_t == ASTNULL) ? ANTLR_USE_NAMESPACE(antlr)nullAST : _t;
785 < #line 218 "MDTreeParser.g"
785 > #line 211 "MDTreeParser.g"
786          int ival;
787 < #line 901 "MDTreeParser.cpp"
787 > #line 788 "MDTreeParser.cpp"
788          
789          try {      // for error handling
790 <                ANTLR_USE_NAMESPACE(antlr)RefAST __t63 = _t;
791 <                ANTLR_USE_NAMESPACE(antlr)RefAST tmp21_AST_in = _t;
790 >                ANTLR_USE_NAMESPACE(antlr)RefAST __t59 = _t;
791 >                ANTLR_USE_NAMESPACE(antlr)RefAST tmp20_AST_in = _t;
792                  match(_t,FRAGMENT);
793                  _t = _t->getFirstChild();
794                  ival=intConst(_t);
795                  _t = _retTree;
796 < #line 219 "MDTreeParser.g"
796 > #line 212 "MDTreeParser.g"
797                  FragmentStamp* currFragmentStamp = new FragmentStamp(ival); blockStack.push(currFragmentStamp);
798 < #line 912 "MDTreeParser.cpp"
798 > #line 799 "MDTreeParser.cpp"
799                  { // ( ... )*
800                  for (;;) {
801                          if (_t == ANTLR_USE_NAMESPACE(antlr)nullAST )
# Line 918 | Line 805 | void MDTreeParser::fragmentblock(ANTLR_USE_NAMESPACE(a
805                                  _t = _retTree;
806                          }
807                          else {
808 <                                goto _loop65;
808 >                                goto _loop61;
809                          }
810                          
811                  }
812 <                _loop65:;
812 >                _loop61:;
813                  } // ( ... )*
814 <                ANTLR_USE_NAMESPACE(antlr)RefAST tmp22_AST_in = _t;
814 >                ANTLR_USE_NAMESPACE(antlr)RefAST tmp21_AST_in = _t;
815                  match(_t,ENDBLOCK);
816                  _t = _t->getNextSibling();
817 <                _t = __t63;
817 >                _t = __t59;
818                  _t = _t->getNextSibling();
819 < #line 221 "MDTreeParser.g"
819 > #line 214 "MDTreeParser.g"
820                  
821                  blockStack.top()->validate();
822                  blockStack.pop();
823                  MoleculeStamp* currMoleculeStamp = static_cast<MoleculeStamp*>(blockStack.top());
824                  currMoleculeStamp->addFragmentStamp(currFragmentStamp);
825                  
826 < #line 940 "MDTreeParser.cpp"
826 > #line 827 "MDTreeParser.cpp"
827          }
828          catch (ANTLR_USE_NAMESPACE(antlr)RecognitionException& ex) {
829                  reportError(ex);
# Line 948 | Line 835 | void MDTreeParser::atomstatement(ANTLR_USE_NAMESPACE(a
835  
836   void MDTreeParser::atomstatement(ANTLR_USE_NAMESPACE(antlr)RefAST _t) {
837          ANTLR_USE_NAMESPACE(antlr)RefAST atomstatement_AST_in = (_t == ASTNULL) ? ANTLR_USE_NAMESPACE(antlr)nullAST : _t;
838 < #line 108 "MDTreeParser.g"
838 > #line 101 "MDTreeParser.g"
839          
840          vector<double> dvec;
841          AtomStamp* currAtomStamp =  static_cast<AtomStamp*>(blockStack.top());
842          
843          
844 < #line 958 "MDTreeParser.cpp"
844 > #line 845 "MDTreeParser.cpp"
845          
846          try {      // for error handling
847                  if (_t == ANTLR_USE_NAMESPACE(antlr)nullAST )
# Line 968 | Line 855 | void MDTreeParser::atomstatement(ANTLR_USE_NAMESPACE(a
855                  }
856                  case POSITION:
857                  {
858 <                        ANTLR_USE_NAMESPACE(antlr)RefAST __t30 = _t;
859 <                        ANTLR_USE_NAMESPACE(antlr)RefAST tmp23_AST_in = _t;
858 >                        ANTLR_USE_NAMESPACE(antlr)RefAST __t26 = _t;
859 >                        ANTLR_USE_NAMESPACE(antlr)RefAST tmp22_AST_in = _t;
860                          match(_t,POSITION);
861                          _t = _t->getFirstChild();
862 <                        dvec=signedNumberTuple(_t);
862 >                        dvec=doubleNumberTuple(_t);
863                          _t = _retTree;
864 <                        _t = __t30;
864 >                        _t = __t26;
865                          _t = _t->getNextSibling();
866 < #line 115 "MDTreeParser.g"
866 > #line 108 "MDTreeParser.g"
867                          currAtomStamp->setPosition(dvec);
868 < #line 982 "MDTreeParser.cpp"
868 > #line 869 "MDTreeParser.cpp"
869                          break;
870                  }
871                  case ORIENTATION:
872                  {
873 <                        ANTLR_USE_NAMESPACE(antlr)RefAST __t31 = _t;
874 <                        ANTLR_USE_NAMESPACE(antlr)RefAST tmp24_AST_in = _t;
873 >                        ANTLR_USE_NAMESPACE(antlr)RefAST __t27 = _t;
874 >                        ANTLR_USE_NAMESPACE(antlr)RefAST tmp23_AST_in = _t;
875                          match(_t,ORIENTATION);
876                          _t = _t->getFirstChild();
877 <                        dvec=signedNumberTuple(_t);
877 >                        dvec=doubleNumberTuple(_t);
878                          _t = _retTree;
879 <                        _t = __t31;
879 >                        _t = __t27;
880                          _t = _t->getNextSibling();
881 < #line 116 "MDTreeParser.g"
881 > #line 109 "MDTreeParser.g"
882                          currAtomStamp->setOrientation(dvec);
883 < #line 997 "MDTreeParser.cpp"
883 > #line 884 "MDTreeParser.cpp"
884                          break;
885                  }
886                  default:
# Line 1010 | Line 897 | void MDTreeParser::atomstatement(ANTLR_USE_NAMESPACE(a
897          _retTree = _t;
898   }
899  
900 < vector<double>  MDTreeParser::signedNumberTuple(ANTLR_USE_NAMESPACE(antlr)RefAST _t) {
901 < #line 234 "MDTreeParser.g"
900 > vector<double>  MDTreeParser::doubleNumberTuple(ANTLR_USE_NAMESPACE(antlr)RefAST _t) {
901 > #line 227 "MDTreeParser.g"
902          vector<double> dvec;
903 < #line 1017 "MDTreeParser.cpp"
904 <        ANTLR_USE_NAMESPACE(antlr)RefAST signedNumberTuple_AST_in = (_t == ASTNULL) ? ANTLR_USE_NAMESPACE(antlr)nullAST : _t;
905 < #line 234 "MDTreeParser.g"
903 > #line 904 "MDTreeParser.cpp"
904 >        ANTLR_USE_NAMESPACE(antlr)RefAST doubleNumberTuple_AST_in = (_t == ASTNULL) ? ANTLR_USE_NAMESPACE(antlr)nullAST : _t;
905 > #line 227 "MDTreeParser.g"
906          
907          double dval;
908          
909 < #line 1023 "MDTreeParser.cpp"
909 > #line 910 "MDTreeParser.cpp"
910          
911          try {      // for error handling
912                  { // ( ... )+
913 <                int _cnt69=0;
913 >                int _cnt65=0;
914                  for (;;) {
915                          if (_t == ANTLR_USE_NAMESPACE(antlr)nullAST )
916                                  _t = ASTNULL;
917 <                        if ((_tokenSet_2.member(_t->getType()))) {
918 <                                dval=signedNumber(_t);
917 >                        if (((_t->getType() >= NUM_INT && _t->getType() <= NUM_DOUBLE))) {
918 >                                dval=doubleNumber(_t);
919                                  _t = _retTree;
920 < #line 238 "MDTreeParser.g"
920 > #line 231 "MDTreeParser.g"
921                                  dvec.push_back(dval);
922 < #line 1036 "MDTreeParser.cpp"
922 > #line 923 "MDTreeParser.cpp"
923                          }
924                          else {
925 <                                if ( _cnt69>=1 ) { goto _loop69; } else {throw ANTLR_USE_NAMESPACE(antlr)NoViableAltException(_t);}
925 >                                if ( _cnt65>=1 ) { goto _loop65; } else {throw ANTLR_USE_NAMESPACE(antlr)NoViableAltException(_t);}
926                          }
927                          
928 <                        _cnt69++;
928 >                        _cnt65++;
929                  }
930 <                _loop69:;
930 >                _loop65:;
931                  }  // ( ... )+
932          }
933          catch (ANTLR_USE_NAMESPACE(antlr)RecognitionException& ex) {
# Line 1054 | Line 941 | void MDTreeParser::bondstatement(ANTLR_USE_NAMESPACE(a
941  
942   void MDTreeParser::bondstatement(ANTLR_USE_NAMESPACE(antlr)RefAST _t) {
943          ANTLR_USE_NAMESPACE(antlr)RefAST bondstatement_AST_in = (_t == ASTNULL) ? ANTLR_USE_NAMESPACE(antlr)nullAST : _t;
944 < #line 129 "MDTreeParser.g"
944 > #line 122 "MDTreeParser.g"
945          
946          vector<int> ivec;
947          BondStamp* currBondStamp = static_cast<BondStamp*>(blockStack.top());
948          
949 < #line 1063 "MDTreeParser.cpp"
949 > #line 950 "MDTreeParser.cpp"
950          
951          try {      // for error handling
952                  if (_t == ANTLR_USE_NAMESPACE(antlr)nullAST )
# Line 1073 | Line 960 | void MDTreeParser::bondstatement(ANTLR_USE_NAMESPACE(a
960                  }
961                  case MEMBERS:
962                  {
963 <                        ANTLR_USE_NAMESPACE(antlr)RefAST __t37 = _t;
964 <                        ANTLR_USE_NAMESPACE(antlr)RefAST tmp25_AST_in = _t;
963 >                        ANTLR_USE_NAMESPACE(antlr)RefAST __t33 = _t;
964 >                        ANTLR_USE_NAMESPACE(antlr)RefAST tmp24_AST_in = _t;
965                          match(_t,MEMBERS);
966                          _t = _t->getFirstChild();
967                          ivec=inttuple(_t);
968                          _t = _retTree;
969 <                        _t = __t37;
969 >                        _t = __t33;
970                          _t = _t->getNextSibling();
971 < #line 135 "MDTreeParser.g"
971 > #line 128 "MDTreeParser.g"
972                          currBondStamp->setMembers(ivec);
973 < #line 1087 "MDTreeParser.cpp"
973 > #line 974 "MDTreeParser.cpp"
974                          break;
975                  }
976                  default:
# Line 1101 | Line 988 | vector<int>  MDTreeParser::inttuple(ANTLR_USE_NAMESPAC
988   }
989  
990   vector<int>  MDTreeParser::inttuple(ANTLR_USE_NAMESPACE(antlr)RefAST _t) {
991 < #line 241 "MDTreeParser.g"
991 > #line 234 "MDTreeParser.g"
992          vector<int> ivec;
993 < #line 1107 "MDTreeParser.cpp"
993 > #line 994 "MDTreeParser.cpp"
994          ANTLR_USE_NAMESPACE(antlr)RefAST inttuple_AST_in = (_t == ASTNULL) ? ANTLR_USE_NAMESPACE(antlr)nullAST : _t;
995 < #line 241 "MDTreeParser.g"
995 > #line 234 "MDTreeParser.g"
996          
997          int ival;
998          
999 < #line 1113 "MDTreeParser.cpp"
999 > #line 1000 "MDTreeParser.cpp"
1000          
1001          try {      // for error handling
1002                  { // ( ... )+
1003 <                int _cnt72=0;
1003 >                int _cnt68=0;
1004                  for (;;) {
1005                          if (_t == ANTLR_USE_NAMESPACE(antlr)nullAST )
1006                                  _t = ASTNULL;
1007 <                        if (((_t->getType() >= OCTALINT && _t->getType() <= HEXADECIMALINT))) {
1007 >                        if ((_t->getType() == NUM_INT || _t->getType() == NUM_LONG)) {
1008                                  ival=intConst(_t);
1009                                  _t = _retTree;
1010 < #line 245 "MDTreeParser.g"
1010 > #line 238 "MDTreeParser.g"
1011                                  ivec.push_back(ival);
1012 < #line 1126 "MDTreeParser.cpp"
1012 > #line 1013 "MDTreeParser.cpp"
1013                          }
1014                          else {
1015 <                                if ( _cnt72>=1 ) { goto _loop72; } else {throw ANTLR_USE_NAMESPACE(antlr)NoViableAltException(_t);}
1015 >                                if ( _cnt68>=1 ) { goto _loop68; } else {throw ANTLR_USE_NAMESPACE(antlr)NoViableAltException(_t);}
1016                          }
1017                          
1018 <                        _cnt72++;
1018 >                        _cnt68++;
1019                  }
1020 <                _loop72:;
1020 >                _loop68:;
1021                  }  // ( ... )+
1022          }
1023          catch (ANTLR_USE_NAMESPACE(antlr)RecognitionException& ex) {
# Line 1144 | Line 1031 | void MDTreeParser::bendstatement(ANTLR_USE_NAMESPACE(a
1031  
1032   void MDTreeParser::bendstatement(ANTLR_USE_NAMESPACE(antlr)RefAST _t) {
1033          ANTLR_USE_NAMESPACE(antlr)RefAST bendstatement_AST_in = (_t == ASTNULL) ? ANTLR_USE_NAMESPACE(antlr)nullAST : _t;
1034 < #line 148 "MDTreeParser.g"
1034 > #line 141 "MDTreeParser.g"
1035          
1036          vector<int> ivec;
1037          BendStamp* currBendStamp = static_cast<BendStamp*>(blockStack.top());
1038          
1039 < #line 1153 "MDTreeParser.cpp"
1039 > #line 1040 "MDTreeParser.cpp"
1040          
1041          try {      // for error handling
1042                  if (_t == ANTLR_USE_NAMESPACE(antlr)nullAST )
# Line 1163 | Line 1050 | void MDTreeParser::bendstatement(ANTLR_USE_NAMESPACE(a
1050                  }
1051                  case MEMBERS:
1052                  {
1053 <                        ANTLR_USE_NAMESPACE(antlr)RefAST __t43 = _t;
1054 <                        ANTLR_USE_NAMESPACE(antlr)RefAST tmp26_AST_in = _t;
1053 >                        ANTLR_USE_NAMESPACE(antlr)RefAST __t39 = _t;
1054 >                        ANTLR_USE_NAMESPACE(antlr)RefAST tmp25_AST_in = _t;
1055                          match(_t,MEMBERS);
1056                          _t = _t->getFirstChild();
1057                          ivec=inttuple(_t);
1058                          _t = _retTree;
1059 <                        _t = __t43;
1059 >                        _t = __t39;
1060                          _t = _t->getNextSibling();
1061 < #line 154 "MDTreeParser.g"
1061 > #line 147 "MDTreeParser.g"
1062                          currBendStamp->setMembers(ivec);
1063 < #line 1177 "MDTreeParser.cpp"
1063 > #line 1064 "MDTreeParser.cpp"
1064                          break;
1065                  }
1066                  default:
# Line 1192 | Line 1079 | void MDTreeParser::torsionstatement(ANTLR_USE_NAMESPAC
1079  
1080   void MDTreeParser::torsionstatement(ANTLR_USE_NAMESPACE(antlr)RefAST _t) {
1081          ANTLR_USE_NAMESPACE(antlr)RefAST torsionstatement_AST_in = (_t == ASTNULL) ? ANTLR_USE_NAMESPACE(antlr)nullAST : _t;
1082 < #line 167 "MDTreeParser.g"
1082 > #line 160 "MDTreeParser.g"
1083          
1084          vector<int> ivec;
1085          TorsionStamp* currTorsionStamp = static_cast<TorsionStamp*>(blockStack.top());
1086          
1087 < #line 1201 "MDTreeParser.cpp"
1087 > #line 1088 "MDTreeParser.cpp"
1088          
1089          try {      // for error handling
1090                  if (_t == ANTLR_USE_NAMESPACE(antlr)nullAST )
# Line 1211 | Line 1098 | void MDTreeParser::torsionstatement(ANTLR_USE_NAMESPAC
1098                  }
1099                  case MEMBERS:
1100                  {
1101 <                        ANTLR_USE_NAMESPACE(antlr)RefAST __t49 = _t;
1102 <                        ANTLR_USE_NAMESPACE(antlr)RefAST tmp27_AST_in = _t;
1101 >                        ANTLR_USE_NAMESPACE(antlr)RefAST __t45 = _t;
1102 >                        ANTLR_USE_NAMESPACE(antlr)RefAST tmp26_AST_in = _t;
1103                          match(_t,MEMBERS);
1104                          _t = _t->getFirstChild();
1105                          ivec=inttuple(_t);
1106                          _t = _retTree;
1107 <                        _t = __t49;
1107 >                        _t = __t45;
1108                          _t = _t->getNextSibling();
1109 < #line 173 "MDTreeParser.g"
1109 > #line 166 "MDTreeParser.g"
1110                          currTorsionStamp->setMembers(ivec);
1111 < #line 1225 "MDTreeParser.cpp"
1111 > #line 1112 "MDTreeParser.cpp"
1112                          break;
1113                  }
1114                  default:
# Line 1240 | Line 1127 | void MDTreeParser::rigidbodystatement(ANTLR_USE_NAMESP
1127  
1128   void MDTreeParser::rigidbodystatement(ANTLR_USE_NAMESPACE(antlr)RefAST _t) {
1129          ANTLR_USE_NAMESPACE(antlr)RefAST rigidbodystatement_AST_in = (_t == ASTNULL) ? ANTLR_USE_NAMESPACE(antlr)nullAST : _t;
1130 < #line 190 "MDTreeParser.g"
1130 > #line 183 "MDTreeParser.g"
1131          
1132          vector<int> ivec;
1133          RigidBodyStamp* currRigidBodyStamp = static_cast<RigidBodyStamp*>(blockStack.top());
1134          
1135 < #line 1249 "MDTreeParser.cpp"
1135 > #line 1136 "MDTreeParser.cpp"
1136          
1137          try {      // for error handling
1138                  if (_t == ANTLR_USE_NAMESPACE(antlr)nullAST )
# Line 1259 | Line 1146 | void MDTreeParser::rigidbodystatement(ANTLR_USE_NAMESP
1146                  }
1147                  case MEMBERS:
1148                  {
1149 <                        ANTLR_USE_NAMESPACE(antlr)RefAST __t55 = _t;
1150 <                        ANTLR_USE_NAMESPACE(antlr)RefAST tmp28_AST_in = _t;
1149 >                        ANTLR_USE_NAMESPACE(antlr)RefAST __t51 = _t;
1150 >                        ANTLR_USE_NAMESPACE(antlr)RefAST tmp27_AST_in = _t;
1151                          match(_t,MEMBERS);
1152                          _t = _t->getFirstChild();
1153                          ivec=inttuple(_t);
1154                          _t = _retTree;
1155 <                        _t = __t55;
1156 <                        _t = _t->getNextSibling();
1157 < #line 196 "MDTreeParser.g"
1155 >                        _t = __t51;
1156 >                        _t = _t->getNextSibling();
1157 > #line 189 "MDTreeParser.g"
1158                          currRigidBodyStamp->setMembers(ivec);
1159 < #line 1273 "MDTreeParser.cpp"
1159 > #line 1160 "MDTreeParser.cpp"
1160                          break;
1161                  }
1162                  default:
# Line 1288 | Line 1175 | void MDTreeParser::cutoffgroupstatement(ANTLR_USE_NAME
1175  
1176   void MDTreeParser::cutoffgroupstatement(ANTLR_USE_NAMESPACE(antlr)RefAST _t) {
1177          ANTLR_USE_NAMESPACE(antlr)RefAST cutoffgroupstatement_AST_in = (_t == ASTNULL) ? ANTLR_USE_NAMESPACE(antlr)nullAST : _t;
1178 < #line 209 "MDTreeParser.g"
1178 > #line 202 "MDTreeParser.g"
1179          
1180          vector<int> ivec;
1181          CutoffGroupStamp* currCutoffGroupStamp = static_cast<CutoffGroupStamp*>(blockStack.top());
1182          
1183 < #line 1297 "MDTreeParser.cpp"
1183 > #line 1184 "MDTreeParser.cpp"
1184          
1185          try {      // for error handling
1186                  if (_t == ANTLR_USE_NAMESPACE(antlr)nullAST )
# Line 1307 | Line 1194 | void MDTreeParser::cutoffgroupstatement(ANTLR_USE_NAME
1194                  }
1195                  case MEMBERS:
1196                  {
1197 <                        ANTLR_USE_NAMESPACE(antlr)RefAST __t61 = _t;
1198 <                        ANTLR_USE_NAMESPACE(antlr)RefAST tmp29_AST_in = _t;
1197 >                        ANTLR_USE_NAMESPACE(antlr)RefAST __t57 = _t;
1198 >                        ANTLR_USE_NAMESPACE(antlr)RefAST tmp28_AST_in = _t;
1199                          match(_t,MEMBERS);
1200                          _t = _t->getFirstChild();
1201                          ivec=inttuple(_t);
1202                          _t = _retTree;
1203 <                        _t = __t61;
1203 >                        _t = __t57;
1204                          _t = _t->getNextSibling();
1205 < #line 215 "MDTreeParser.g"
1205 > #line 208 "MDTreeParser.g"
1206                          currCutoffGroupStamp->setMembers(ivec);
1207 < #line 1321 "MDTreeParser.cpp"
1207 > #line 1208 "MDTreeParser.cpp"
1208                          break;
1209                  }
1210                  default:
# Line 1349 | Line 1236 | void MDTreeParser::fragmentstatement(ANTLR_USE_NAMESPA
1236          _retTree = _t;
1237   }
1238  
1239 < double  MDTreeParser::signedNumber(ANTLR_USE_NAMESPACE(antlr)RefAST _t) {
1240 < #line 256 "MDTreeParser.g"
1239 > double  MDTreeParser::doubleNumber(ANTLR_USE_NAMESPACE(antlr)RefAST _t) {
1240 > #line 248 "MDTreeParser.g"
1241          double dval;
1242 < #line 1356 "MDTreeParser.cpp"
1243 <        ANTLR_USE_NAMESPACE(antlr)RefAST signedNumber_AST_in = (_t == ASTNULL) ? ANTLR_USE_NAMESPACE(antlr)nullAST : _t;
1357 <        ANTLR_USE_NAMESPACE(antlr)RefAST icMinus = ANTLR_USE_NAMESPACE(antlr)nullAST;
1358 <        ANTLR_USE_NAMESPACE(antlr)RefAST fcMinus = ANTLR_USE_NAMESPACE(antlr)nullAST;
1242 > #line 1243 "MDTreeParser.cpp"
1243 >        ANTLR_USE_NAMESPACE(antlr)RefAST doubleNumber_AST_in = (_t == ASTNULL) ? ANTLR_USE_NAMESPACE(antlr)nullAST : _t;
1244          ANTLR_USE_NAMESPACE(antlr)RefAST ic = ANTLR_USE_NAMESPACE(antlr)nullAST;
1245          ANTLR_USE_NAMESPACE(antlr)RefAST fc = ANTLR_USE_NAMESPACE(antlr)nullAST;
1246          
# Line 1363 | Line 1248 | double  MDTreeParser::signedNumber(ANTLR_USE_NAMESPACE
1248                  if (_t == ANTLR_USE_NAMESPACE(antlr)nullAST )
1249                          _t = ASTNULL;
1250                  switch ( _t->getType()) {
1251 <                case MINUS:
1251 >                case NUM_INT:
1252 >                case NUM_LONG:
1253                  {
1254 <                        ANTLR_USE_NAMESPACE(antlr)RefAST __t75 = _t;
1255 <                        ANTLR_USE_NAMESPACE(antlr)RefAST tmp30_AST_in = _t;
1256 <                        match(_t,MINUS);
1257 <                        _t = _t->getFirstChild();
1258 <                        {
1259 <                        if (_t == ANTLR_USE_NAMESPACE(antlr)nullAST )
1374 <                                _t = ASTNULL;
1375 <                        switch ( _t->getType()) {
1376 <                        case OCTALINT:
1377 <                        case DECIMALINT:
1378 <                        case HEXADECIMALINT:
1379 <                        {
1380 <                                icMinus = (_t == ASTNULL) ? ANTLR_USE_NAMESPACE(antlr)nullAST : _t;
1381 <                                intConst(_t);
1382 <                                _t = _retTree;
1383 < #line 257 "MDTreeParser.g"
1384 <                                dval = lexi_cast<double>(icMinus->getText()); dval = -dval;
1385 < #line 1386 "MDTreeParser.cpp"
1386 <                                break;
1387 <                        }
1388 <                        case FLOATONE:
1389 <                        case FLOATTWO:
1390 <                        {
1391 <                                fcMinus = (_t == ASTNULL) ? ANTLR_USE_NAMESPACE(antlr)nullAST : _t;
1392 <                                floatConst(_t);
1393 <                                _t = _retTree;
1394 <                                break;
1395 <                        }
1396 <                        default:
1397 <                        {
1398 <                                throw ANTLR_USE_NAMESPACE(antlr)NoViableAltException(_t);
1399 <                        }
1400 <                        }
1401 <                        }
1402 < #line 258 "MDTreeParser.g"
1403 <                        dval = lexi_cast<double>(fcMinus->getText());dval = -dval;
1404 < #line 1405 "MDTreeParser.cpp"
1405 <                        _t = __t75;
1406 <                        _t = _t->getNextSibling();
1254 >                        ic = (_t == ASTNULL) ? ANTLR_USE_NAMESPACE(antlr)nullAST : _t;
1255 >                        intConst(_t);
1256 >                        _t = _retTree;
1257 > #line 250 "MDTreeParser.g"
1258 >                        dval = lexi_cast<double>(ic->getText());
1259 > #line 1260 "MDTreeParser.cpp"
1260                          break;
1261                  }
1262 <                case OCTALINT:
1263 <                case DECIMALINT:
1411 <                case HEXADECIMALINT:
1412 <                case FLOATONE:
1413 <                case FLOATTWO:
1262 >                case NUM_FLOAT:
1263 >                case NUM_DOUBLE:
1264                  {
1265 <                        {
1266 <                        if (_t == ANTLR_USE_NAMESPACE(antlr)nullAST )
1267 <                                _t = ASTNULL;
1268 <                        switch ( _t->getType()) {
1269 <                        case OCTALINT:
1270 <                        case DECIMALINT:
1421 <                        case HEXADECIMALINT:
1422 <                        {
1423 <                                ic = (_t == ASTNULL) ? ANTLR_USE_NAMESPACE(antlr)nullAST : _t;
1424 <                                intConst(_t);
1425 <                                _t = _retTree;
1426 < #line 260 "MDTreeParser.g"
1427 <                                dval = lexi_cast<double>(ic->getText());
1428 < #line 1429 "MDTreeParser.cpp"
1429 <                                break;
1430 <                        }
1431 <                        case FLOATONE:
1432 <                        case FLOATTWO:
1433 <                        {
1434 <                                fc = (_t == ASTNULL) ? ANTLR_USE_NAMESPACE(antlr)nullAST : _t;
1435 <                                floatConst(_t);
1436 <                                _t = _retTree;
1437 < #line 261 "MDTreeParser.g"
1438 <                                dval = lexi_cast<double>(fc->getText());
1439 < #line 1440 "MDTreeParser.cpp"
1440 <                                break;
1441 <                        }
1442 <                        default:
1443 <                        {
1444 <                                throw ANTLR_USE_NAMESPACE(antlr)NoViableAltException(_t);
1445 <                        }
1446 <                        }
1447 <                        }
1265 >                        fc = (_t == ASTNULL) ? ANTLR_USE_NAMESPACE(antlr)nullAST : _t;
1266 >                        floatConst(_t);
1267 >                        _t = _retTree;
1268 > #line 251 "MDTreeParser.g"
1269 >                        dval = lexi_cast<double>(fc->getText());
1270 > #line 1271 "MDTreeParser.cpp"
1271                          break;
1272                  }
1273                  default:
# Line 1495 | Line 1318 | const char* MDTreeParser::tokenNames[] = {
1318          "LPAREN",
1319          "RPAREN",
1320          "COMMA",
1321 <        "OCTALINT",
1322 <        "DECIMALINT",
1323 <        "HEXADECIMALINT",
1324 <        "PLUS",
1502 <        "MINUS",
1503 <        "FLOATONE",
1504 <        "FLOATTWO",
1321 >        "NUM_INT",
1322 >        "NUM_LONG",
1323 >        "NUM_FLOAT",
1324 >        "NUM_DOUBLE",
1325          "DOT",
1326          "COLON",
1327          "QUESTIONMARK",
# Line 1514 | Line 1334 | const char* MDTreeParser::tokenNames[] = {
1334          "CharLiteral",
1335          "EndOfLine",
1336          "Escape",
1337 +        "Vocabulary",
1338          "Digit",
1339          "Decimal",
1340 <        "LongSuffix",
1341 <        "UnsignedSuffix",
1342 <        "FloatSuffix",
1522 <        "Exponent",
1523 <        "Vocabulary",
1524 <        "Number",
1340 >        "HEX_DIGIT",
1341 >        "EXPONENT",
1342 >        "FLOAT_SUFFIX",
1343          0
1344   };
1345  
# Line 1532 | Line 1350 | const ANTLR_USE_NAMESPACE(antlr)BitSet MDTreeParser::_
1350   // "atom" "bond" "bend" "torsion" "rigidBody" "cutoffGroup" "fragment"
1351   // ASSIGNEQUAL
1352   const ANTLR_USE_NAMESPACE(antlr)BitSet MDTreeParser::_tokenSet_1(_tokenSet_1_data_,4);
1535 – const unsigned long MDTreeParser::_tokenSet_2_data_[] = { 3758096384UL, 14UL, 0UL, 0UL };
1536 – // OCTALINT DECIMALINT HEXADECIMALINT MINUS FLOATONE FLOATTWO
1537 – const ANTLR_USE_NAMESPACE(antlr)BitSet MDTreeParser::_tokenSet_2(_tokenSet_2_data_,4);
1353  
1354  

Diff Legend

– Removed lines
+ Added lines
< Changed lines
> Changed lines