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root/OpenMD/branches/development/src/nonbonded/InteractionManager.cpp
(Generate patch)

Comparing branches/development/src/nonbonded/InteractionManager.cpp (file contents):
Revision 1502 by gezelter, Sat Oct 2 19:53:32 2010 UTC vs.
Revision 1710 by gezelter, Fri May 18 21:44:02 2012 UTC

# Line 36 | Line 36
36   * [1]  Meineke, et al., J. Comp. Chem. 26, 252-271 (2005).            
37   * [2]  Fennell & Gezelter, J. Chem. Phys. 124, 234104 (2006).          
38   * [3]  Sun, Lin & Gezelter, J. Chem. Phys. 128, 24107 (2008).          
39 < * [4]  Vardeman & Gezelter, in progress (2009).                        
39 > * [4]  Kuang & Gezelter,  J. Chem. Phys. 133, 164101 (2010).
40 > * [5]  Vardeman, Stocker & Gezelter, J. Chem. Theory Comput. 7, 834 (2011).
41   */
42  
43   #include "nonbonded/InteractionManager.hpp"
44  
45   namespace OpenMD {
45 –
46 –  bool InteractionManager::initialized_ = false;
47 –  ForceField* InteractionManager::forceField_ = NULL;  
48 –  InteractionManager* InteractionManager::_instance = NULL;
49 –  map<int, AtomType*> InteractionManager::typeMap_;
50 –  map<pair<AtomType*, AtomType*>, set<NonBondedInteraction*> > InteractionManager::interactions_;
51 –
52 –  InteractionManager* InteractionManager::Instance() {
53 –    if (!_instance) {
54 –      _instance = new InteractionManager();
55 –    }
56 –    return _instance;
57 –  }
46  
47 <  void InteractionManager::initialize() {
48 <    
47 >  InteractionManager::InteractionManager() {
48 >
49 >    initialized_ = false;
50 >        
51      lj_ = new LJ();
52      gb_ = new GB();
53      sticky_ = new Sticky();
54 +    morse_ = new Morse();
55 +    repulsivePower_ = new RepulsivePower();
56      eam_ = new EAM();
57      sc_ = new SC();
66 –    morse_ = new Morse();
58      electrostatic_ = new Electrostatic();
59 +    maw_ = new MAW();
60 +  }
61  
62 +  void InteractionManager::initialize() {
63 +    
64 +    ForceField* forceField_ = info_->getForceField();
65 +    
66      lj_->setForceField(forceField_);
67      gb_->setForceField(forceField_);
68      sticky_->setForceField(forceField_);
69      eam_->setForceField(forceField_);
70      sc_->setForceField(forceField_);
71      morse_->setForceField(forceField_);
72 +    electrostatic_->setSimInfo(info_);
73      electrostatic_->setForceField(forceField_);
74 +    maw_->setForceField(forceField_);
75 +    repulsivePower_->setForceField(forceField_);
76  
77      ForceField::AtomTypeContainer* atomTypes = forceField_->getAtomTypes();
78      ForceField::AtomTypeContainer::MapTypeIterator i1, i2;
# Line 85 | Line 85 | namespace OpenMD {
85           atype1 = atomTypes->nextType(i1)) {
86        
87        // add it to the map:
88 –      AtomTypeProperties atp = atype1->getATP();    
88        
89        pair<map<int,AtomType*>::iterator,bool> ret;    
90 <      ret = typeMap_.insert( pair<int, AtomType*>(atp.ident, atype1) );
90 >      ret = typeMap_.insert( pair<int, AtomType*>(atype1->getIdent(), atype1) );
91        if (ret.second == false) {
92          sprintf( painCave.errMsg,
93                   "InteractionManager already had a previous entry with ident %d\n",
94 <                 atp.ident);
94 >                 atype1->getIdent());
95          painCave.severity = OPENMD_INFO;
96          painCave.isFatal = 0;
97          simError();                
# Line 143 | Line 142 | namespace OpenMD {
142          // look for an explicitly-set non-bonded interaction type using the
143          // two atom types.
144          NonBondedInteractionType* nbiType = forceField_->getNonBondedInteractionType(atype1->getName(), atype2->getName());
145 +        
146 +        if (nbiType != NULL) {
147  
148 <        if (nbiType->isLennardJones()) {
149 <          // We found an explicit Lennard-Jones interaction.  
150 <          // override all other vdw entries for this pair of atom types:
151 <          set<NonBondedInteraction*>::iterator it;
152 <          for (it = interactions_[key].begin(); it != interactions_[key].end(); ++it) {
153 <            InteractionFamily ifam = (*it)->getFamily();
154 <            if (ifam == VANDERWAALS_FAMILY) interactions_[key].erase(*it);
148 >          if (nbiType->isLennardJones()) {
149 >            // We found an explicit Lennard-Jones interaction.  
150 >            // override all other vdw entries for this pair of atom types:
151 >            set<NonBondedInteraction*>::iterator it;
152 >            for (it = interactions_[key].begin();
153 >                 it != interactions_[key].end(); ++it) {
154 >              InteractionFamily ifam = (*it)->getFamily();
155 >              if (ifam == VANDERWAALS_FAMILY) interactions_[key].erase(*it);
156 >            }
157 >            interactions_[key].insert(lj_);
158 >            vdwExplicit = true;
159            }
160 <          interactions_[key].insert(lj_);
161 <          vdwExplicit = true;
162 <        }
163 <
164 <        if (nbiType->isMorse()) {
165 <          if (vdwExplicit) {
166 <            sprintf( painCave.errMsg,
167 <                     "InteractionManager::initialize found more than one explicit\n"
168 <                     "\tvan der Waals interaction for atom types %s - %s\n",
169 <                     atype1->getName().c_str(), atype2->getName().c_str());
170 <            painCave.severity = OPENMD_ERROR;
171 <            painCave.isFatal = 1;
172 <            simError();
160 >          
161 >          if (nbiType->isMorse()) {
162 >            if (vdwExplicit) {
163 >              sprintf( painCave.errMsg,
164 >                       "InteractionManager::initialize found more than one "
165 >                       "explicit \n"
166 >                       "\tvan der Waals interaction for atom types %s - %s\n",
167 >                       atype1->getName().c_str(), atype2->getName().c_str());
168 >              painCave.severity = OPENMD_ERROR;
169 >              painCave.isFatal = 1;
170 >              simError();
171 >            }
172 >            // We found an explicit Morse interaction.  
173 >            // override all other vdw entries for this pair of atom types:
174 >            set<NonBondedInteraction*>::iterator it;
175 >            for (it = interactions_[key].begin();
176 >                 it != interactions_[key].end(); ++it) {
177 >              InteractionFamily ifam = (*it)->getFamily();
178 >              if (ifam == VANDERWAALS_FAMILY) interactions_[key].erase(*it);
179 >            }
180 >            interactions_[key].insert(morse_);
181 >            vdwExplicit = true;
182            }
169 –          // We found an explicit Morse interaction.  
170 –          // override all other vdw entries for this pair of atom types:
171 –          set<NonBondedInteraction*>::iterator it;
172 –          for (it = interactions_[key].begin(); it != interactions_[key].end(); ++it) {
173 –            InteractionFamily ifam = (*it)->getFamily();
174 –            if (ifam == VANDERWAALS_FAMILY) interactions_[key].erase(*it);
175 –          }
176 –          interactions_[key].insert(morse_);
177 –          vdwExplicit = true;
178 –        }
183  
184 <        if (nbiType->isEAM()) {
185 <          // We found an explicit EAM interaction.  
186 <          // override all other metallic entries for this pair of atom types:
187 <          set<NonBondedInteraction*>::iterator it;
188 <          for (it = interactions_[key].begin(); it != interactions_[key].end(); ++it) {
189 <            InteractionFamily ifam = (*it)->getFamily();
190 <            if (ifam == METALLIC_FAMILY) interactions_[key].erase(*it);
191 <          }
192 <          interactions_[key].insert(eam_);
193 <          metExplicit = true;
194 <        }
195 <
196 <        if (nbiType->isSC()) {
197 <          if (metExplicit) {
198 <            sprintf( painCave.errMsg,
199 <                     "InteractionManager::initialize found more than one explicit\n"
200 <                     "\tmetallic interaction for atom types %s - %s\n",
201 <                     atype1->getName().c_str(), atype2->getName().c_str());
202 <            painCave.severity = OPENMD_ERROR;
203 <            painCave.isFatal = 1;
204 <            simError();
201 <          }
202 <          // We found an explicit Sutton-Chen interaction.  
203 <          // override all other metallic entries for this pair of atom types:
204 <          set<NonBondedInteraction*>::iterator it;
205 <          for (it = interactions_[key].begin(); it != interactions_[key].end(); ++it) {
206 <            InteractionFamily ifam = (*it)->getFamily();
207 <            if (ifam == METALLIC_FAMILY) interactions_[key].erase(*it);
184 >          if (nbiType->isRepulsivePower()) {
185 >            if (vdwExplicit) {
186 >              sprintf( painCave.errMsg,
187 >                       "InteractionManager::initialize found more than one "
188 >                       "explicit \n"
189 >                       "\tvan der Waals interaction for atom types %s - %s\n",
190 >                       atype1->getName().c_str(), atype2->getName().c_str());
191 >              painCave.severity = OPENMD_ERROR;
192 >              painCave.isFatal = 1;
193 >              simError();
194 >            }
195 >            // We found an explicit RepulsivePower interaction.  
196 >            // override all other vdw entries for this pair of atom types:
197 >            set<NonBondedInteraction*>::iterator it;
198 >            for (it = interactions_[key].begin();
199 >                 it != interactions_[key].end(); ++it) {
200 >              InteractionFamily ifam = (*it)->getFamily();
201 >              if (ifam == VANDERWAALS_FAMILY) interactions_[key].erase(*it);
202 >            }
203 >            interactions_[key].insert(repulsivePower_);
204 >            vdwExplicit = true;
205            }
206 <          interactions_[key].insert(sc_);
207 <          metExplicit = true;
206 >          
207 >          
208 >          if (nbiType->isEAM()) {
209 >            // We found an explicit EAM interaction.  
210 >            // override all other metallic entries for this pair of atom types:
211 >            set<NonBondedInteraction*>::iterator it;
212 >            for (it = interactions_[key].begin();
213 >                 it != interactions_[key].end(); ++it) {
214 >              InteractionFamily ifam = (*it)->getFamily();
215 >              if (ifam == METALLIC_FAMILY) interactions_[key].erase(*it);
216 >            }
217 >            interactions_[key].insert(eam_);
218 >            metExplicit = true;
219 >          }
220 >          
221 >          if (nbiType->isSC()) {
222 >            if (metExplicit) {
223 >              sprintf( painCave.errMsg,
224 >                       "InteractionManager::initialize found more than one "
225 >                       "explicit\n"
226 >                       "\tmetallic interaction for atom types %s - %s\n",
227 >                       atype1->getName().c_str(), atype2->getName().c_str());
228 >              painCave.severity = OPENMD_ERROR;
229 >              painCave.isFatal = 1;
230 >              simError();
231 >            }
232 >            // We found an explicit Sutton-Chen interaction.  
233 >            // override all other metallic entries for this pair of atom types:
234 >            set<NonBondedInteraction*>::iterator it;
235 >            for (it = interactions_[key].begin();
236 >                 it != interactions_[key].end(); ++it) {
237 >              InteractionFamily ifam = (*it)->getFamily();
238 >              if (ifam == METALLIC_FAMILY) interactions_[key].erase(*it);
239 >            }
240 >            interactions_[key].insert(sc_);
241 >            metExplicit = true;
242 >          }
243 >          
244 >          if (nbiType->isMAW()) {
245 >            if (vdwExplicit) {
246 >              sprintf( painCave.errMsg,
247 >                       "InteractionManager::initialize found more than one "
248 >                       "explicit\n"
249 >                       "\tvan der Waals interaction for atom types %s - %s\n",
250 >                       atype1->getName().c_str(), atype2->getName().c_str());
251 >              painCave.severity = OPENMD_ERROR;
252 >              painCave.isFatal = 1;
253 >              simError();
254 >            }
255 >            // We found an explicit MAW interaction.  
256 >            // override all other vdw entries for this pair of atom types:
257 >            set<NonBondedInteraction*>::iterator it;
258 >            for (it = interactions_[key].begin();
259 >                 it != interactions_[key].end(); ++it) {
260 >              InteractionFamily ifam = (*it)->getFamily();
261 >              if (ifam == VANDERWAALS_FAMILY) interactions_[key].erase(*it);
262 >            }
263 >            interactions_[key].insert(maw_);
264 >            vdwExplicit = true;
265 >          }        
266          }
267        }
268      }
269      
270 <    // make sure every pair of atom types has a non-bonded interaction:
271 <    for (atype1 = atomTypes->beginType(i1); atype1 != NULL;
272 <         atype1 = atomTypes->nextType(i1)) {
273 <      for (atype2 = atomTypes->beginType(i2); atype2 != NULL;
274 <           atype2 = atomTypes->nextType(i2)) {
270 >    
271 >    // Make sure every pair of atom types in this simulation has a
272 >    // non-bonded interaction.  If not, just inform the user.
273 >
274 >    set<AtomType*> simTypes = info_->getSimulatedAtomTypes();
275 >    set<AtomType*>::iterator it, jt;
276 >
277 >    for (it = simTypes.begin(); it != simTypes.end(); ++it) {
278 >      atype1 = (*it);
279 >      for (jt = it; jt != simTypes.end(); ++jt) {
280 >        atype2 = (*jt);
281          key = make_pair(atype1, atype2);
282          
283          if (interactions_[key].size() == 0) {
284            sprintf( painCave.errMsg,
285 <                   "InteractionManager unable to find an appropriate non-bonded\n"
286 <                   "\tinteraction for atom types %s - %s\n",
285 >                   "InteractionManager could not find a matching non-bonded\n"
286 >                   "\tinteraction for atom types %s - %s\n"
287 >                   "\tProceeding without this interaction.\n",
288                     atype1->getName().c_str(), atype2->getName().c_str());
289            painCave.severity = OPENMD_INFO;
290 <          painCave.isFatal = 1;
290 >          painCave.isFatal = 0;
291            simError();
292          }
293        }
294      }
233 –  }
295  
296 +    initialized_ = true;
297 +  }
298  
299 <  void InteractionManager::doPrePair(AtomType* atype1,
237 <                                     AtomType* atype2,
238 <                                     RealType rij,
239 <                                     RealType &rho_i_at_j,
240 <                                     RealType &rho_j_at_i) {
299 >  void InteractionManager::setCutoffRadius(RealType rcut) {
300      
301 +    electrostatic_->setCutoffRadius(rcut);
302 +    eam_->setCutoffRadius(rcut);
303    }
243 –  
244 –  void InteractionManager::doPreForce(AtomType* atype,
245 –                                      RealType rho,      
246 –                                      RealType &frho,
247 –                                      RealType &dfrhodrho) {
248 –  }
304  
305 <  void InteractionManager::doSkipCorrection(AtomType* atype1,      
306 <                                            AtomType* atype2,
252 <                                            Vector3d d,
253 <                                            RealType rij,
254 <                                            RealType &skippedCharge1,
255 <                                            RealType &skippedCharge2,
256 <                                            RealType sw,
257 <                                            RealType electroMult,
258 <                                            RealType &pot,
259 <                                            RealType &vpair,
260 <                                            Vector3d &f1,
261 <                                            Mat3x3d eFrame1,
262 <                                            Mat3x3d eFrame2,
263 <                                            Vector3d &t1,
264 <                                            Vector3d &t2) {
305 >  void InteractionManager::setSwitchingRadius(RealType rswitch) {
306 >    electrostatic_->setSwitchingRadius(rswitch);
307    }
308    
309 <  void InteractionManager::doSelfCorrection(AtomType* atype,
268 <                                            Mat3x3d eFrame,
269 <                                            RealType skippedCharge,
270 <                                            RealType &pot,
271 <                                            Vector3d &t) {
272 <  }
273 <
274 <  void InteractionManager::do_prepair(int *atid1, int *atid2, RealType *rij, RealType *rho_i_at_j, RealType *rho_j_at_i){
309 >  void InteractionManager::doPrePair(InteractionData idat){
310      
311      if (!initialized_) initialize();
312 <    AtomType* atype1 = typeMap_[*atid1];
313 <    AtomType* atype2 = typeMap_[*atid2];
312 >        
313 >    // excluded interaction, so just return
314 >    if (idat.excluded) return;
315 >
316 >    set<NonBondedInteraction*>::iterator it;
317 >
318 >    for (it = interactions_[ idat.atypes ].begin();
319 >         it != interactions_[ idat.atypes ].end(); ++it){
320 >      if ((*it)->getFamily() == METALLIC_FAMILY) {
321 >        dynamic_cast<MetallicInteraction*>(*it)->calcDensity(idat);
322 >      }
323 >    }
324      
280 –    doPrePair(atype1, atype2, *rij, *rho_i_at_j, *rho_j_at_i);
281 –    
325      return;    
326    }
327 +  
328 +  void InteractionManager::doPreForce(SelfData sdat){
329  
330 <  void InteractionManager::do_preforce(int *atid, RealType *rho, RealType *frho, RealType *dfrhodrho){
286 <
287 <    if (!initialized_) initialize();    
288 <    AtomType* atype = typeMap_[*atid];
289 <
290 <    doPreForce(atype, *rho, *frho, *dfrhodrho);
330 >    if (!initialized_) initialize();
331      
332 +    pair<AtomType*, AtomType*> key = make_pair(sdat.atype, sdat.atype);
333 +    set<NonBondedInteraction*>::iterator it;
334 +    
335 +    for (it = interactions_[key].begin(); it != interactions_[key].end(); ++it){
336 +      if ((*it)->getFamily() == METALLIC_FAMILY) {
337 +        dynamic_cast<MetallicInteraction*>(*it)->calcFunctional(sdat);
338 +      }
339 +    }
340 +    
341      return;    
342    }
343  
344 <  void InteractionManager::do_pair(int *atid1, int *atid2, RealType *d, RealType *r, RealType *r2, RealType *rcut, RealType *sw, RealType *vdwMult,RealType *electroMult, RealType *pot, RealType *vpair, RealType *f1, RealType *eFrame1, RealType *eFrame2, RealType *A1, RealType *A2, RealType *t1, RealType *t2, RealType *rho1, RealType *rho2, RealType *dfrho1, RealType *dfrho2, RealType *fshift1, RealType *fshift2){
345 <
344 >  void InteractionManager::doPair(InteractionData idat){
345 >    
346      if (!initialized_) initialize();
298 –          
299 –    InteractionData idat;
347  
301 –    idat.atype1 = typeMap_[*atid1];
302 –    idat.atype2 = typeMap_[*atid2];
303 –    idat.d = Vector3d(d);
304 –    idat.rij = *r;
305 –    idat.r2 = *r2;
306 –    idat.rcut = *rcut;
307 –    idat.sw = *sw;
308 –    idat.vdwMult = *vdwMult;
309 –    idat.electroMult = *electroMult;
310 –    idat.pot = *pot;
311 –    idat.vpair = *vpair;
312 –    idat.f1 = Vector3d(f1);
313 –    idat.eFrame1 = Mat3x3d(eFrame1);
314 –    idat.eFrame2 = Mat3x3d(eFrame2);
315 –    idat.A1 = RotMat3x3d(A1);
316 –    idat.A2 = RotMat3x3d(A2);
317 –    idat.t1 = Vector3d(t1);
318 –    idat.t2 = Vector3d(t2);
319 –    idat.rho1 = *rho1;
320 –    idat.rho2 = *rho2;
321 –    idat.dfrho1 = *dfrho1;
322 –    idat.dfrho2 = *dfrho2;
323 –    idat.fshift1 = *fshift1;
324 –    idat.fshift2 = *fshift2;
325 –
326 –    pair<AtomType*, AtomType*> key = make_pair(idat.atype1, idat.atype2);
348      set<NonBondedInteraction*>::iterator it;
349  
350 <    for (it = interactions_[key].begin(); it != interactions_[key].end(); ++it)
351 <      (*it)->calcForce(idat);
331 <    
332 <    f1[0] = idat.f1.x();
333 <    f1[1] = idat.f1.y();
334 <    f1[2] = idat.f1.z();
335 <    
336 <    t1[0] = idat.t1.x();
337 <    t1[1] = idat.t1.y();
338 <    t1[2] = idat.t1.z();
339 <    
340 <    t2[0] = idat.t2.x();
341 <    t2[1] = idat.t2.y();
342 <    t2[2] = idat.t2.z();
350 >    for (it = interactions_[ idat.atypes ].begin();
351 >         it != interactions_[ idat.atypes ].end(); ++it) {
352  
353 +      // electrostatics still has to worry about indirect
354 +      // contributions from excluded pairs of atoms:
355 +
356 +      if (!idat.excluded || (*it)->getFamily() == ELECTROSTATIC_FAMILY) {
357 +        (*it)->calcForce(idat);
358 +      }
359 +    }
360 +    
361      return;    
362    }
363  
364 <  void InteractionManager::do_skip_correction(int *atid1, int *atid2, RealType *d, RealType *r, RealType *skippedCharge1, RealType *skippedCharge2, RealType *sw, RealType *electroMult, RealType *pot, RealType *vpair, RealType *f1, RealType *eFrame1, RealType *eFrame2, RealType *t1, RealType *t2){
364 >  void InteractionManager::doSelfCorrection(SelfData sdat){
365  
366      if (!initialized_) initialize();
350 –          
351 –    AtomType* atype1 = typeMap_[*atid1];
352 –    AtomType* atype2 = typeMap_[*atid2];
353 –    Vector3d disp(d);
354 –    Vector3d frc(f1);
355 –    Vector3d trq1(t1);
356 –    Vector3d trq2(t2);
357 –    Mat3x3d eFi(eFrame1);
358 –    Mat3x3d eFj(eFrame2);
359 –      
360 –    doSkipCorrection(atype1, atype2, disp, *r, *skippedCharge1, *skippedCharge2, *sw,
361 –                     *electroMult, *pot,  *vpair, frc, eFi, eFj, trq1, trq2);
362 –
363 –    f1[0] = frc.x();
364 –    f1[1] = frc.y();
365 –    f1[2] = frc.z();
367      
368 <    t1[0] = trq1.x();
369 <    t1[1] = trq1.y();
369 <    t1[2] = trq1.z();
370 <    
371 <    t2[0] = trq2.x();
372 <    t2[1] = trq2.y();
373 <    t2[2] = trq2.z();
368 >    pair<AtomType*, AtomType*> key = make_pair(sdat.atype, sdat.atype);
369 >    set<NonBondedInteraction*>::iterator it;
370  
371 <    return;
371 >    for (it = interactions_[key].begin(); it != interactions_[key].end(); ++it){
372 >      if ((*it)->getFamily() == ELECTROSTATIC_FAMILY) {
373 >        dynamic_cast<ElectrostaticInteraction*>(*it)->calcSelfCorrection(sdat);
374 >      }
375 >    }
376 >      
377 >    return;    
378    }
379  
380 <  void InteractionManager::do_self_correction(int *atid, RealType *eFrame, RealType *skippedCharge, RealType *pot, RealType *t){
379 <
380 >  RealType InteractionManager::getSuggestedCutoffRadius(int *atid) {
381      if (!initialized_) initialize();
382 <          
382 >    
383      AtomType* atype = typeMap_[*atid];
383 –    Mat3x3d eFi(eFrame);
384 –    Vector3d trq1(t);
385 –      
386 –    doSelfCorrection(atype, eFi, *skippedCharge, *pot, trq1);
384  
385 <    t[0] = trq1.x();
386 <    t[1] = trq1.y();
387 <    t[2] = trq1.z();
391 <
392 <    return;
393 <  }
394 <
395 < } //end namespace OpenMD
396 <
397 < extern "C" {
398 <  
399 < #define fortranDoPrePair FC_FUNC(do_prepair, DO_PREPAIR)
400 < #define fortranDoPreForce FC_FUNC(do_preforce, DO_PREFORCE)
401 < #define fortranDoPair FC_FUNC(do_pair, DO_PAIR)
402 < #define fortranDoSkipCorrection FC_FUNC(do_skip_correction, DO_SKIP_CORRECTION)
403 < #define fortranDoSelfCorrection FC_FUNC(do_self_correction, DO_SELF_CORRECTION)
404 < #define fortranGetCutoff FC_FUNC(get_cutoff, GET_CUTOFF)
405 <
406 <  void fortranDoPrePair(int *atid1, int *atid2, RealType *rij,
407 <                        RealType *rho_i_at_j, RealType *rho_j_at_i) {
408 <            
409 <    return OpenMD::InteractionManager::Instance()->do_prepair(atid1, atid2, rij,
410 <                                                              rho_i_at_j,  
411 <                                                              rho_j_at_i);
412 <  }
413 <  void fortranDoPreforce(int *atid, RealType *rho, RealType *frho,
414 <                         RealType *dfrhodrho) {  
385 >    pair<AtomType*, AtomType*> key = make_pair(atype, atype);
386 >    set<NonBondedInteraction*>::iterator it;
387 >    RealType cutoff = 0.0;
388      
389 <    return OpenMD::InteractionManager::Instance()->do_preforce(atid, rho, frho,
390 <                                                               dfrhodrho);    
389 >    for (it = interactions_[key].begin(); it != interactions_[key].end(); ++it)
390 >      cutoff = max(cutoff, (*it)->getSuggestedCutoffRadius(key));  
391 >    return cutoff;    
392    }
419 –  
420 –  void fortranDoPair(int *atid1, int *atid2, RealType *d, RealType *r,
421 –                     RealType *r2, RealType *rcut, RealType *sw, RealType *vdwMult,
422 –                     RealType *electroMult, RealType *pot, RealType *vpair, RealType *f1,
423 –                     RealType *eFrame1, RealType *eFrame2, RealType *A1, RealType *A2,
424 –                     RealType *t1, RealType *t2,
425 –                     RealType *rho1, RealType *rho2, RealType *dfrho1, RealType *dfrho2,
426 –                     RealType *fshift1, RealType *fshift2){
427 –    
428 –    return OpenMD::InteractionManager::Instance()->do_pair(atid1, atid2, d, r, r2, rcut,
429 –                                                           sw, vdwMult, electroMult, pot,
430 –                                                           vpair, f1, eFrame1, eFrame2,
431 –                                                           A1, A2, t1, t2, rho1, rho2,
432 –                                                           dfrho1, dfrho2, fshift1, fshift2);
433 –  }
393  
394 <  void fortranDoSkipCorrection(int *atid1, int *atid2, RealType *d, RealType *r,
395 <                               RealType *skippedCharge1, RealType *skippedCharge2,
437 <                               RealType *sw, RealType *electroMult, RealType *pot,
438 <                               RealType *vpair, RealType *f1,
439 <                               RealType *eFrame1, RealType *eFrame2,
440 <                               RealType *t1, RealType *t2){
394 >  RealType InteractionManager::getSuggestedCutoffRadius(AtomType* atype) {
395 >    if (!initialized_) initialize();
396      
397 <    return OpenMD::InteractionManager::Instance()->do_skip_correction(atid1, atid2, d, r,
398 <                                                                      skippedCharge1,
399 <                                                                      skippedCharge2,
445 <                                                                      sw, electroMult, pot,
446 <                                                                      vpair, f1, eFrame1,
447 <                                                                      eFrame2, t1, t2);
448 <  }
449 <
450 <  void fortranDoSelfCorrection(int *atid, RealType *eFrame, RealType *skippedCharge,
451 <                               RealType *pot, RealType *t) {
397 >    pair<AtomType*, AtomType*> key = make_pair(atype, atype);
398 >    set<NonBondedInteraction*>::iterator it;
399 >    RealType cutoff = 0.0;
400      
401 <    return OpenMD::InteractionManager::Instance()->do_self_correction(atid, eFrame,
402 <                                                                      skippedCharge,
403 <                                                                      pot, t);
401 >    for (it = interactions_[key].begin(); it != interactions_[key].end(); ++it)
402 >      cutoff = max(cutoff, (*it)->getSuggestedCutoffRadius(key));  
403 >    return cutoff;    
404    }
405 <  RealType fortranGetCutoff() {
458 <    return OpenMD::InteractionManager::Instance()->getCutoff();
459 <  }
460 < }
405 > } //end namespace OpenMD

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